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Tporker

金虫 (小有名气)

[求助] 毕赤酵母表达实验设计 已有1人参与

欲进行毕赤酵母表达一个真核蛋白,实验设计如下:
合成基因:两端采用EcoRⅠ和NotⅠ酶切位点双酶切连接进入pPIC9K中。
提取pPIC9K-目的基因,SacⅠ线性化后电转化进入GS115,MD平板筛选。
将MD平板的菌落进行过夜培养,粗提取基因组,进行基因组PCR(5‘AOX/3’AOX)鉴定阳性菌落。
将鉴定的阳性克隆,挑取在BMGY培养基中过夜,收集菌体,转入BMMY中进行诱导表达,取不同时间点的上清和菌体进行SDS-PAGE,查看是否能够诱导表达成功。
不知道这个大概思路怎么样?按照这个大致步骤做下来不知道可不可行?
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值,夜渐浓,闻窗外蛙鸣,辗转无眠难入梦;此,风渐清,听庭内雨应,悱恻浮醒忆青笼。
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xiaopeiliang

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-17 13:46:58
引用回帖:
4楼: Originally posted by Tporker at 2013-12-17 09:51:43
请问在进行基因组PCR(5‘AOX/3’AOX)鉴定阳性菌落时候,PCR反应体系设计是否像普通PCR一样模板添加量为整个体系的1/20甚至更少?还是需要多加一点基因组?
体系:
Taq   Buffer(含Mg+)       1.5
3AOX      ...

做的时候提取点GS115的空白对照基因组做个通用引物PCR看看,每次做之前做好对照,就会排除你的这些问题了,基因组可以电泳看看,不过因为量少而P不到的概率比较小,可能是那个步骤操作没注意吧,实验设计的是没有问题的
5楼2013-12-17 10:31:21
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

基本就是你写的这些,可行
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2013-12-16 22:00:34
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Tporker

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gyesang at 2013-12-16 22:00:34
基本就是你写的这些,可行

好的,谢谢
值,夜渐浓,闻窗外蛙鸣,辗转无眠难入梦;此,风渐清,听庭内雨应,悱恻浮醒忆青笼。
3楼2013-12-17 09:32:16
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Tporker

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gyesang at 2013-12-16 22:00:34
基本就是你写的这些,可行

请问在进行基因组PCR(5‘AOX/3’AOX)鉴定阳性菌落时候,PCR反应体系设计是否像普通PCR一样模板添加量为整个体系的1/20甚至更少?还是需要多加一点基因组?
体系:
Taq   Buffer(含Mg+)       1.5
3AOX                               0.5
5AOX                               0.5
Taq                                  0.3
dNTPs                               0.5
基因组                              0.3
H2O                                 12
总                                    15
不知道是不是基因组少了?进行了几次都没有条带。Mut+本应该有条2200的条带的,,但是几次都没有,不知道是不是模板不够?
值,夜渐浓,闻窗外蛙鸣,辗转无眠难入梦;此,风渐清,听庭内雨应,悱恻浮醒忆青笼。
4楼2013-12-17 09:51:43
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