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syd89522

木虫 (小有名气)

[求助] 请问如何用amber进行π-π相互作用的分析 已有4人参与

我想计算色氨酸和苯丙氨酸之间的π-π相互作用,请问这类作用的判据有哪些?需要用什么命令?如何来编写脚本文件呢?
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走自己的路,让别人说去吧~不以物喜,不以己悲
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ningll10

新虫 (小有名气)


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-01-12 09:22:27
我之前是这样做的,第一,做出两个残基的RDF,就是径向分布,看他们之间的距离,然后把苯环之间的面面角给算出来,做一个分布,看看是不是平行或反平行为主
7楼2014-01-10 10:38:26
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