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请问如何用amber进行π-π相互作用的分析
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syd89522
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性别: GG
专业: 理论和计算化学
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请问如何用amber进行π-π相互作用的分析
已有4人参与
我想计算色氨酸和苯丙氨酸之间的π-π相互作用,请问这类作用的判据有哪些?需要用什么命令?如何来编写脚本文件呢?
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syd89522
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走自己的路,让别人说去吧~不以物喜,不以己悲
1楼
2013-12-11 16:53:09
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ningll10
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帖子: 129
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虫号: 2605597
注册: 2013-08-19
专业: 生物化学
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流
2014-01-12 09:22:27
我之前是这样做的,第一,做出两个残基的RDF,就是径向分布,看他们之间的距离,然后把苯环之间的面面角给算出来,做一个分布,看看是不是平行或反平行为主
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7楼
2014-01-10 10:38:26
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