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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 线粒体长片段扩增总是失败，有什么好的建议吗？
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积云降晚露

新虫 (小有名气)

[求助] 线粒体长片段扩增总是失败，有什么好的建议吗？ 已有3人参与

我用的longPCR反应程序试过几种不同的方法，前后也设计了数对引物，均没有好的效果，至今只有一对引物偶能出来疑似目的长度的片段，尝试送测多次都没测出来。。引物做梯度退火没有效果。。期间也换了LA Taq酶，结果扩出来的像marker一样，还是测不出。。请问还有什么办法吗？感激！

[ Last edited by silicare on 2014-2-17 at 11:58 ]
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1楼 2013-12-03 14:14:45
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积云降晚露

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by kentgrey at 2014-02-02 23:06:10
可以试试将这个长片段分成两部分克啊
前提是在NCBI上找得到中间片段相似部分，再根据保守序列多设计几对引物
按线粒体的自身性质，母系遗传来找参考基因设计引物

谢谢您的建议~不过我缺的那段包含控制区，变异大，已经找不到中间可以设计引物的地方了。。唉。。。
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3楼2014-02-16 17:48:01
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