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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 基因组电泳图怪异
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wangweijian

金虫 (小有名气)

[求助] 基因组电泳图怪异

今天刚提的革兰氏阳性菌基因组DNA，0.8% 琼脂糖凝胶，测得浓度有600ng/uL；OD260/280：2.0-2.1之间；OD260/230：2.4左右。上样量：3uL(1uL loading buffer+2uL 样品）；Marker 上样量：2uL。电泳跑成那样，不知是什么原因？
基因组电泳图怪异
IMG_1020.jpg
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1楼 2013-11-26 16:33:00
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wsq5574792

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wangweijian: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-11-28 08:40:19
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-12-02 16:04:26
勉强提到了，但是很不纯。OD260/280偏高，然后下面的拖峰很明显。证明你的DNA有很多碎片。看看是不是你震荡太厉害了。
建议重新提DNA，震荡不要太剧烈，上下颠倒就好。
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我是一个贼，一个偷心的贼。
2楼2013-11-27 15:59:36
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梧桐柒夕

主管区长 (文坛精英)

优秀区长优秀区长优秀区长优秀区长优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wangweijian: 金币+1, ★有帮助 2013-11-28 08:40:41
wangweijian: 金币+1 2013-11-28 08:41:19
Marker是什么？选个合适的Marker，多跑一会儿下面的片段应该能跑掉。
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轻描淡写，浓墨重彩。
3楼2013-11-27 16:23:28
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夏天的普洱茶

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
wangweijian: 金币+1 2013-11-28 08:40:59
没有除RNA吧,下面都是RNA，放两天就降解了
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4楼2013-11-27 19:57:52
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wangweijian

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wsq5574792 at 2013-11-27 15:59:36
勉强提到了，但是很不纯。OD260/280偏高，然后下面的拖峰很明显。证明你的DNA有很多碎片。看看是不是你震荡太厉害了。
建议重新提DNA，震荡不要太剧烈，上下颠倒就好。

那下面黄色的东西是什么啊？
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5楼2013-11-28 08:36:49
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wangweijian

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 梧桐柒夕 at 2013-11-27 16:23:28
Marker是什么？选个合适的Marker，多跑一会儿下面的片段应该能跑掉。

Marker IV,7000bp-500bp 范围
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6楼2013-11-28 08:37:15
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wangweijian

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 夏天的普洱茶 at 2013-11-27 19:57:52
没有除RNA吧,下面都是RNA，放两天就降解了

刚提出来就这样，一天都没放过
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7楼2013-11-28 08:37:42
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三蛰

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wangweijian: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-11-29 08:38:09
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-12-02 16:04:39
下面的拖尾还算正常，我分析应该不是dna碎片，因为如果碎了，应该会出现一个“泳道”全是拖带，即碎片的大小不会这么固定到一个范围。不过含量的确不高。虽然分光光度仪的数据挺好，但是……
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我不会！
8楼2013-11-28 09:21:38
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梧桐柒夕

主管区长 (文坛精英)

优秀区长优秀区长优秀区长优秀区长优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

什么菌？它的基因组多大？
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轻描淡写，浓墨重彩。
9楼2013-11-28 11:03:05
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夏天的普洱茶

木虫 (著名写手)
★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-12-02 16:05:25
引用回帖:
7楼: Originally posted by wangweijian at 2013-11-28 08:37:42
刚提出来就这样，一天都没放过...

我的意思是下面的小片段是RNA，你在提取的时候有没有加RNA酶，如果没有加，就肯定是RNA了，放几天下面的小带就自然没有了。我之前提不加RNA酶就会出现这样的现象，
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10楼2013-11-28 21:56:57
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