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fafa5420

新虫 (初入文坛)

[求助] 请教关于基因全长的问题

关于一个还没有基因组测序的物种,通过NCBI搜索得到的基因序列如何确定其5'端是否已经扩增到全长?已经从cDNA中克隆得到一个1100bp左右的基因,3'端已经有终止密码子,有完整的ORF,怕在第一个ATG前还有ATG,可能会让基因再长个几十几百bp,除了做race以外还有什么途径解决,另外如何判断已经扩增到基因的5'端全长,谢谢!
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liankaiqi

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我也想知道这个问题该怎么处理!谢谢
充实的路上享受生活
2楼2013-11-07 16:34:09
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David勇

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-11-12 15:38:46
应该只有RACE这种方法吧。smart 技术能在5‘端甲基化位点加CCC所以能确定是全长mRNA。
3楼2013-11-12 14:07:42
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wsliuqiulei

铜虫 (初入文坛)

我也很想知道怎样确定自己扩出来的已经是全长了,求助解决
4楼2014-01-02 15:37:01
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