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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 有没有人做过细菌全基因组测序DNA提取的？
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1989青苹果

铁杆木虫 (职业作家)

[交流] 有没有人做过细菌全基因组测序DNA提取的？ 已有2人参与

大家使用试剂盒提取还是手提的呢？方法有吗？
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仰望天空。
1楼 2013-09-27 11:29:37
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文库构建

铁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库，怎样提取高质量的DNA很关键。
细菌基因组DNA的制备
　　一、材料
　　细菌培养物。
　　二、设备
　　移液管, 高速冷冻离心机, 台式离心机，水浴锅。
　　三、试剂
　　1、CTAB/NaCl溶液：4.1g NaCl溶解于80ml H2 O,缓慢加入10g CTAB,加水至100ml。
　　2、其它试剂：氯仿:异戊醇(24:1)，酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)，异丙醇，70% 乙醇，TE，10% SDS，蛋白酶 K (20mg/ml或粉剂)，5mol/L NaCl。
　　四、操作步骤：
　　1. 100ml 细菌过夜培养液, 5000rpm离心10分钟, 去上清液。
　　2. 加9.5ml TE悬浮沉淀, 并加0.5ml 10% SDS, 50μl 20mg/ml(或1mg干粉)蛋白酶 K, 混匀, 37℃保温1小时。
　　3. 加1.5ml 5mol/L NaCl, 混匀。
　　4. 加1.5ml CTAB/NaCl溶液, 混匀, 65℃保温20分钟。
　　5. 用等体积酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提, 5000rpm离心10分钟, 将上清液移至干净离心管。
　　6. 用等体积氯仿:异戊醇(24:1)抽提, 取上清液移至干净管中。
　　7. 加1倍体积异丙醇, 颠倒混合, 室温下静止10分钟，沉淀DNA。
　　8. 用玻棒捞出DNA沉淀, 70%乙醇漂洗后, 吸干,溶解于1ml TE, -20℃保存。如DNA沉淀无法捞出,可5000rpm离心, 使DNA沉淀。
　　9. 如要除去其中的RNA, 可以按本章第三节中操作步骤处理。

来源：百博明创（北京）
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5楼2013-10-16 09:57:02
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yandz680717

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
promega细菌基因组提取试剂盒，我抽提生物基因组，公司觉得质量蛮好的
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2楼2013-10-06 08:17:36
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yandz680717

木虫 (正式写手)
抽提微生物基因组
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3楼2013-10-06 08:18:13
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1989青苹果

铁杆木虫 (职业作家)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yandz680717 at 2013-10-06 08:17:36
promega细菌基因组提取试剂盒，我抽提生物基因组，公司觉得质量蛮好的

是少量提取还是大量提取的？

[ 发自小木虫客户端 ]
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仰望天空。
4楼2013-10-06 14:14:22
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