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1989青苹果

铁杆木虫 (职业作家)

[交流] 有没有人做过细菌全基因组测序DNA提取的? 已有2人参与

大家使用试剂盒提取还是手提的呢?方法有吗?
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yandz680717

木虫 (正式写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
promega细菌基因组提取试剂盒,我抽提生物基因组,公司觉得质量蛮好的
2楼2013-10-06 08:17:36
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yandz680717

木虫 (正式写手)

抽提微生物基因组
3楼2013-10-06 08:18:13
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1989青苹果

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yandz680717 at 2013-10-06 08:17:36
promega细菌基因组提取试剂盒,我抽提生物基因组,公司觉得质量蛮好的

是少量提取还是大量提取的?

[ 发自小木虫客户端 ]
仰望天空。
4楼2013-10-06 14:14:22
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文库构建

铁虫 (小有名气)


★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库,怎样提取高质量的DNA很关键。
细菌基因组DNA的制备
  一、材料
  细菌培养物。
  二、设备
  移液管, 高速冷冻离心机, 台式离心机,水浴锅。
  三、试剂
  1、CTAB/NaCl溶液:4.1g NaCl溶解于80ml H2 O,缓慢加入10g CTAB,加水至100ml。
  2、其它试剂:氯仿:异戊醇(24:1),酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),异丙醇,70% 乙醇,TE,10% SDS,蛋白酶 K (20mg/ml或粉剂),5mol/L NaCl。
  四、操作步骤:
  1. 100ml 细菌过夜培养液, 5000rpm离心10分钟, 去上清液。
  2. 加9.5ml TE悬浮沉淀, 并加0.5ml 10% SDS, 50μl 20mg/ml(或1mg干粉)蛋白酶 K, 混匀, 37℃保温1小时。
  3. 加1.5ml 5mol/L NaCl, 混匀。
  4. 加1.5ml CTAB/NaCl溶液, 混匀, 65℃保温20分钟。
  5. 用等体积酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提, 5000rpm离心10分钟, 将上清液移至干净离心管。
  6. 用等体积氯仿:异戊醇(24:1)抽提, 取上清液移至干净管中。
  7. 加1倍体积异丙醇, 颠倒混合, 室温下静止10分钟,沉淀DNA。
  8. 用玻棒捞出DNA沉淀, 70%乙醇漂洗后, 吸干,溶解于1ml TE, -20℃保存。如DNA沉淀无法捞出,可5000rpm离心, 使DNA沉淀。
  9. 如要除去其中的RNA, 可以按本章第三节中操作步骤处理。

来源:百博明创(北京)
5楼2013-10-16 09:57:02
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1989青苹果

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 文库构建 at 2013-10-16 09:57:02
基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库,怎样提取高质量的DNA很关键。
细菌基因组DNA的制备
  一、材料
  细菌培养物。
  二、设备
  移液管, 高速冷冻离心机, 台式离心机,水浴锅。
  三、试 ...

谢谢啦
仰望天空。
6楼2013-10-16 11:06:17
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