[求助] 用16S测序鉴定单一菌株的困惑

3楼: Originally posted by wangfei179 at 2013-07-22 10:42:12
首先，通过液体培养基富集而不经单菌落划线，富集液中是不可能得到单菌的，因此PCR结果肯定是菌群16S；其次，PCR扩增时为减少误差最好用高保真酶。另外，文库建好后先做个酶切分型再测序。PS：自养菌平板培养要求不 ...

6楼: Originally posted by 见神一笑 at 2013-07-24 09:23:15
你这个应该没什么问题，我觉得，序列同源性在99%以上一般都可以确定为同种了，当然你想要分株的话，最好还是用涂布试试

7楼: Originally posted by 大工小军 at 2013-07-25 08:33:59
我最近也要做自养菌的16sRNA,我是打算养完菌，把离完心的干菌，拿到宝生物那边给我测定，不知道结果如何呢？你那边最近有没有结果，希望多交流一下啊。。。

11楼: Originally posted by youyou8285 at 2013-07-30 16:39:26
应该是富集后获得了相近菌的群落，不是单一菌株。这种现象很普遍，可能存在基因水平转移造成

10楼: Originally posted by hkqgeoffrey at 2013-07-30 12:55:42
16S方法中同源性>=97%,通过构建系统同源进化树位于同枝，数值 >73  ，采用NJ或ML两种以上方法进化树稳定就可以基本判定同种了，如果不放心可以再通过生理生化或其他方法辅助鉴定