24小时热门版块排行榜

返回列表

clearth

木虫之王 (正式写手)

应助: 3 (幼儿园)
金币: 66469.6
帖子: 561
在线: 289.1小时
虫号: 840005

[交流] 【求助/交流】如何从GENBANK上查询菌株的的Acession No

我从DGGE上对条带进行切割、测序后到NCBI上BLAST，获得相似性最高的菌株排列（图一和二），但不知从哪里获得Acession No，应该不是图一中的第一列，也不是图二中的ACCESSION那一行吧。我看到文献上Acession No一般都是“2个字母+5个阿拉伯数字”的形式，烦请各路大侠赐教！

[ Last edited by scelab on 2011-4-5 at 10:39 ]

回复此楼

» 猜你喜欢

职称评审没过，求安慰已经有49人回复
26申博自荐已经有3人回复
A期刊撤稿已经有4人回复
垃圾破二本职称评审标准已经有17人回复
投稿Elsevier的Neoplasia杂志，到最后选publishing options时页面空白，不能完成投稿已经有22人回复
EST投稿状态问题已经有7人回复
毕业后当辅导员了，天天各种学生超烦已经有4人回复
三无产品还有机会吗已经有6人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

幼稚问题一个，在Genbank上查某基因，为何会出现两个mRNA，两个CDS区？已经有12人回复
求助百度上的一篇文献：如何查找基因序列？——在Genbank中寻找目的基因的实例已经有2人回复
寻求把细菌的16s rDNA序列提交到Genbank，申请accession number 的专家-谢谢！已经有3人回复
细菌鉴定--blast后一定要再到Genbank中检索才能确定什么菌，得到accession number吗？已经有12人回复
向genbank提交序列之后，收到一信件，需要提供有关样品的信息？有人遇到过么？救赎已经有19人回复
我向Genbank提交了序列并收到了登录号，可我把那封邮件弄没了，怎么再获得登录号？已经有12人回复
【求助/交流】求关于序列上传到GENBANK的相关问题已经有5人回复
【求助/交流】有登陆号，如何批量从Genbank中导出fasta格式的核酸序列已经有6人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴

1楼 2011-04-05 08:38:26

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

scelab

荣誉版主 (文坛精英)

★ ★ ★
rainwander(金币+3): 鼓励交流~~ 2011-04-05 12:07:06
clearth(金币+10): 2011-04-05 17:09:05

你说的这些可以
只是有些小小的区别
比较长的那些是做全基因组测序的时候的片段编号
带下划线的是NCBI ref no，写文章时这些都可以用

建议用图1的，NC_014976是全基因组的no，你的片段没这么长

赞一下(1人)

回复此楼

2楼2011-04-05 10:37:42

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

biogas

木虫 (初入文坛)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 1637
帖子: 24
在线: 31.1小时
虫号: 1081471

ACCESSION

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wolfebst(金币+1): 谢谢你的支持 2011-04-08 11:17:15

ACCESSION

序列记录的唯一识别码，常由字母和数字组成，不会改变，RefSeq（专家标释）数据库中的登录号为两个字母跟一下划线后加6个或更多数字组成
如  NT_123456       指constructed genomic  contigs
   NM_123456    指mRNAs
   NP_123456       指proteins
   NC_123456       指chromosomes

赞一下(2人)

回复此楼

3楼2011-04-06 18:03:08

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖