应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】如何从GENBANK上查询菌株的的Acession No
51/1返回列表
查看: 2281  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

clearth

木虫之王 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】如何从GENBANK上查询菌株的的Acession No

我从DGGE上对条带进行切割、测序后到NCBI上BLAST，获得相似性最高的菌株排列（图一和二），但不知从哪里获得Acession No，应该不是图一中的第一列，也不是图二中的ACCESSION那一行吧。我看到文献上Acession No一般都是“2个字母+5个阿拉伯数字”的形式，烦请各路大侠赐教！




[ Last edited by scelab on 2011-4-5 at 10:39 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-04-05 08:38:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mirror3895

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
rainwander(金币+1): 鼓励 2011-04-09 14:26:12
你这个在比对的时候没有设置好参数吧，比对结果都是genome，DGGE比出来的应该是16S rRNA gene partial sequence.
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2011-04-09 11:55:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

scelab

荣誉版主 (文坛精英)
★ ★ ★
rainwander(金币+3): 鼓励交流~~ 2011-04-05 12:07:06
clearth(金币+10): 2011-04-05 17:09:05
你说的这些可以
只是有些小小的区别
比较长的那些是做全基因组测序的时候的片段编号
带下划线的是NCBI ref no，写文章时这些都可以用

建议用图1的，NC_014976是全基因组的no，你的片段没这么长
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-04-05 10:37:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

biogas

木虫 (初入文坛)

ACCESSION

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wolfebst(金币+1): 谢谢你的支持 2011-04-08 11:17:15
ACCESSION

序列记录的唯一识别码，常由字母和数字组成，不会改变，RefSeq（专家标释）数据库中的登录号为两个字母跟一下划线后加6个或更多数字组成
如  NT_123456        指constructed genomic  contigs
       NM_123456      指mRNAs
       NP_123456        指proteins
       NC_123456        指chromosomes
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2011-04-06 18:03:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mirror3895

铁杆木虫 (正式写手)
看不见你的图，呵呵
赞一下 回复此楼
4楼2011-04-08 09:37:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭