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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 请大家推荐个能进行蛋白质与蛋白质对接的软件
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1054950560

金虫 (正式写手)

[求助] 请大家推荐个能进行蛋白质与蛋白质对接的软件

大家有做过蛋白质与蛋白质进行对接的吗？请给推荐个这方面的软件。谢谢大家。另外，使用amber能做蛋白质之间的动力学么？谢谢大家
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努力就会有回报，不管是好的还是坏的
1楼 2013-07-16 09:02:04
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sydtyx

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
1054950560: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-09-05 08:36:43
Rosetta 可以吧，可以用amber跑protein-protein的动力学
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4楼2013-09-04 15:34:10
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longytu

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
1054950560: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢哈，我去搜搜 2013-07-16 15:08:49
推荐HEX蛋白-蛋白对接软件
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2楼2013-07-16 10:37:42
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liuqiang2270

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
1054950560: 金币+3, ★★★很有帮助, 感谢，我看看 2013-07-17 08:24:14
discover studio在创腾官网上见过，没用过
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3楼2013-07-16 22:25:19
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1054950560

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sydtyx at 2013-09-04 15:34:10
Rosetta 可以吧，可以用amber跑protein-protein的动力学

我们实验室倒是用的amber，在跑动力学的时候，结合能怎么弄呢？对接完以后得到复合物的PDB，直接对复合物跑动力学，在之前的处理的时候，我想得到每个蛋白质的top文件，不过貌似不怎么行，你是不是在做这方面的东西啊，以后可以多交流下啊。
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努力就会有回报，不管是好的还是坏的
5楼2013-09-05 08:36:28
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