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shuifen1108金虫 (正式写手)
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蛋白质中有杂原子怎么做对接啊
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| 我在建模的过程中在蛋白质中引入了杂原子，结果蛋白质的模型就不能够优化了，分子对接也坐不了，我想问一下，有什么办法可以保留杂原子然后进行模型优化和分子对接。谢谢！ |
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shuifen1108
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2楼2012-09-18 14:55:45
3楼2012-09-18 16:14:38
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4楼2012-09-18 21:11:52
【答案】应助回帖
★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-09-18 23:36:07
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-09-18 23:36:07
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还有含As的蛋白啊~高级啊~AD4貌似没有As的力场~估计够呛能做 附：AUTODOCK支持的原子类型 http://iop.vast.ac.vn/theor/conf ... ock/parameters.html [ Last edited by zh1987hs on 2012-9-18 at 21:26 ] |
5楼2012-09-18 21:22:57
shuifen1108
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6楼2012-09-19 19:07:37
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7楼2012-09-19 19:08:54
zhang_chen
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ld处理金属离子还是不错的。8楼2012-09-19 21:14:10
shuifen1108
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9楼2012-09-20 09:33:57