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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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shuifen1108

超级版主

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[求助] 蛋白质中有杂原子怎么做对接啊

我在建模的过程中在蛋白质中引入了杂原子,结果蛋白质的模型就不能够优化了,分子对接也坐不了,我想问一下,有什么办法可以保留杂原子然后进行模型优化和分子对接。谢谢!
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shuifen1108

专家顾问

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好的  我试一下,谢谢啊
9楼2012-09-20 09:33:57
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shuifen1108

超级版主

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我用autodock做对接的
2楼2012-09-18 14:55:45
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zh1987hs

主管区长

分子模拟新手

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【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-09-18 20:12:05
要是金属离子的话ad应该还是可以做对接的~你的优化指的是什么方法?
3楼2012-09-18 16:14:38
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shuifen1108

兑换贵宾

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引用回帖:
3楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-09-18 16:14:38
要是金属离子的话ad应该还是可以做对接的~你的优化指的是什么方法?

我的蛋白质中含As和Cl,用autodock对接的时候出现错误,显示As不能被识别,不知道用什么方法可以消除这种错误
4楼2012-09-18 21:11:52
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