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甘草桔梗

新虫 (初入文坛)

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[求助] 怎样判断一个新基因序列完不完整呢？

小虫用转录组数据库的unigene和3‘race获得了1600左右的序列，3'基本完整，5‘端做了一次步移。测序回来的结果是步移序列3’端80bp左右认为是该蛋白，之前的400bp则比对不上，这里怀疑是内含子。
用几种软件进行ORF分析，均表示该原有序列（不含这次步移增加的序列，增加步移获得的400bp去分析仍为同样的ORF）含有一个翻译411个氨基酸的读码框，但是该411氨基酸均是从其他物种该蛋白的200位之后开始的。
请问，能否认为已经获得了完整的ORF？
本人觉得不是，但是，请问高手有什么办法继续推进呢？
不胜感激啊！

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1楼 2013-07-15 16:02:24

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智能机器人

Robot (super robot)

我们都爱小木虫

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