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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 不同来源的同一种微生物基因序列是否相同
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whjhx

金虫 (正式写手)

[交流] 不同来源的同一种微生物基因序列是否相同

同一种方法分离自不同地方，比如水、土壤或植物中的同一种微生物，其16S或18S rRNA序列会否不同？或者是否有实质性或功能性的不同？
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1楼 2011-07-15 14:33:06
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gaoyang636

木虫 (著名写手)
★
whjhx(金币+1):谢谢参与
同一种微生物? 怎么确定是同一种微生物的？
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2楼2011-07-15 16:33:35
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)
★
whjhx(金币+1):谢谢参与
同一种，不是同一株的话，序列一般不会相同的
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3楼2011-07-15 18:06:27
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whjhx

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2011-07-15 18:06:27:
同一种，不是同一株的话，序列一般不会相同的

谢谢！分离的几株不同来源的微生物确定是同一种，已不需要鉴定，那测16s或18s还有意义吗？测出的16s或18s序列如果有不同能说明什么问题啊？
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4楼2011-07-15 18:24:46
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)
whjhx(金币+2): 2011-07-15 21:50:16
引用回帖:
Originally posted by whjhx at 2011-07-15 18:24:46:
谢谢！分离的几株不同来源的微生物确定是同一种，已不需要鉴定，那测16s或18s还有意义吗？测出的16s或18s序列如果有不同能说明什么问题啊？

个人认为，如果你别的鉴定方法已经能够非常确定了，可以不用测了，如果不是非常确定的话，测一下16S或18S也算是一个证剧吧，能够 让人更加信服。。我觉得肯定是不同的，不过，估计相似度会达到99%，这也是一种证明它们关系非常近啊。。。
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5楼2011-07-15 20:41:54
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whjhx

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2011-07-15 20:41:54:
个人认为，如果你别的鉴定方法已经能够非常确定了，可以不用测了，如果不是非常确定的话，测一下16S或18S也算是一个证剧吧，能够 让人更加信服。。我觉得肯定是不同的，不过，估计相似度会达到99%，这也是一种 ...

同一种方法分离自不同地方的同一种微生物，已确定是同种，而且就我个人的目的来说它们的功能是基本相同的，不知道还能利用它们做什么？直白说就是怎么利用它们发篇PAPER呢？
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6楼2011-07-16 09:29:05
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by whjhx at 2011-07-16 09:29:05:
同一种方法分离自不同地方的同一种微生物，已确定是同种，而且就我个人的目的来说它们的功能是基本相同的，不知道还能利用它们做什么？直白说就是怎么利用它们发篇PAPER呢？

这个……不太清楚了。。。我觉得可以和你们课题组的多 交流一下。。
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7楼2011-07-16 16:18:57
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duke01361

铜虫 (小有名气)
★
whjhx(金币+1):谢谢参与
16SrRNA应该看不出差别来的，其他基因，比如代谢有关的可能会存在差异
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9楼2011-08-29 21:57:05
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zhangxn2010

木虫 (著名写手)
★
whjhx(金币+1):谢谢参与
既然已经可以确定同种，我觉得极端保守的ITS不会有差别
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10楼2011-08-30 12:31:36
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wanhscn

木虫 (职业作家)
★
whjhx(金币+1):谢谢参与
不好讲，有些进化速度慢的单细胞生物序列差不多。细菌就差异大！
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11楼2011-08-30 12:34:03
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Anson1358

铁杆木虫 (著名写手)
★
whjhx(金币+1):谢谢参与
既然是同一种，那序列为什么会不一样呢？不太明白！
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12楼2011-08-30 12:42:20
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简单回复
qqaoqq8楼
2011-08-29 17:47   回复  
whjhx(金币+1):谢谢参与
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