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whjhx

金虫 (正式写手)


[交流] 不同来源的同一种微生物基因序列是否相同

同一种方法分离自不同地方,比如水、土壤或植物中的同一种微生物,其16S或18S rRNA序列会否不同?或者是否有实质性或功能性的不同?
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gaoyang636

木虫 (著名写手)



whjhx(金币+1):谢谢参与
同一种微生物? 怎么确定是同一种微生物的?
2楼2011-07-15 16:33:35
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)



whjhx(金币+1):谢谢参与
同一种,不是同一株的话,序列一般不会相同的
3楼2011-07-15 18:06:27
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whjhx

金虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2011-07-15 18:06:27:
同一种,不是同一株的话,序列一般不会相同的

谢谢!分离的几株不同来源的微生物确定是同一种,已不需要鉴定,那测16s或18s还有意义吗?测出的16s或18s序列如果有不同能说明什么问题啊?
4楼2011-07-15 18:24:46
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)


whjhx(金币+2): 2011-07-15 21:50:16
引用回帖:
Originally posted by whjhx at 2011-07-15 18:24:46:
谢谢!分离的几株不同来源的微生物确定是同一种,已不需要鉴定,那测16s或18s还有意义吗?测出的16s或18s序列如果有不同能说明什么问题啊?

个人认为,如果你别的鉴定方法已经能够非常确定了,可以不用测了,如果不是非常确定的话,测一下16S或18S也算是一个证剧吧,能够 让人更加信服。。我觉得肯定是不同的,不过,估计相似度会达到99%,这也是一种证明它们关系非常近啊。。。
5楼2011-07-15 20:41:54
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whjhx

金虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2011-07-15 20:41:54:
个人认为,如果你别的鉴定方法已经能够非常确定了,可以不用测了,如果不是非常确定的话,测一下16S或18S也算是一个证剧吧,能够 让人更加信服。。我觉得肯定是不同的,不过,估计相似度会达到99%,这也是一种 ...

同一种方法分离自不同地方的同一种微生物,已确定是同种,而且就我个人的目的来说它们的功能是基本相同的,不知道还能利用它们做什么?直白说就是怎么利用它们发篇PAPER呢?
6楼2011-07-16 09:29:05
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by whjhx at 2011-07-16 09:29:05:
同一种方法分离自不同地方的同一种微生物,已确定是同种,而且就我个人的目的来说它们的功能是基本相同的,不知道还能利用它们做什么?直白说就是怎么利用它们发篇PAPER呢?

这个……不太清楚了。。。我觉得可以和你们课题组的多 交流一下。。
7楼2011-07-16 16:18:57
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duke01361

铜虫 (小有名气)



whjhx(金币+1):谢谢参与
16SrRNA应该看不出差别来的,其他基因,比如代谢有关的可能会存在差异
9楼2011-08-29 21:57:05
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zhangxn2010

木虫 (著名写手)



whjhx(金币+1):谢谢参与
既然已经可以确定同种,我觉得极端保守的ITS不会有差别
10楼2011-08-30 12:31:36
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wanhscn

木虫 (职业作家)



whjhx(金币+1):谢谢参与
不好讲,有些进化速度慢的单细胞生物序列差不多。细菌就差异大!
11楼2011-08-30 12:34:03
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Anson1358

铁杆木虫 (著名写手)



whjhx(金币+1):谢谢参与
既然是同一种,那序列为什么会不一样呢?不太明白!
12楼2011-08-30 12:42:20
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简单回复
qqaoqq8楼
2011-08-29 17:47   回复  
whjhx(金币+1):谢谢参与
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