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小小米呐

新虫 (小有名气)

[交流] SDS-PAGE分离胶浓度如何选择已有9人参与

各位最近在做SDS-PAGE实验,要分的蛋白分子量大概是2KD--40KD,应该选择多大的分离胶和夹层胶浓度呢?之前尝试过分离胶、夹层胶、浓缩胶分别是15%、10%、6%,可是跑胶时间居然是六七个小时,电压是从80V到200V,而且Marker看不到任何痕迹,急急急!!!!
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myprayer

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-07-13 18:59:05
gyesang: 金币+3, 热心虫子,很全面! 2013-07-14 02:38:22
楼主,之前类似的帖子已经有了,可以简单的搜索一下,我之前给一个虫子应助过该问题:
觉得主要是由于电泳槽没有正确装配,电流未形成通路。包括:a.内外槽装反;b.外槽液过少;c.电泳槽底部的绝缘体未去掉(比如倒胶用的橡胶皮)。
处理办法:电泳槽正确装配即可。

在电泳前移除胶盒底部的封条;确认缓冲液没过加样孔;检查buffer core上导线连接
常规出现的问题如下以及注意事项如下:
注意事项:
1、 固定玻璃板时,两边用力一定要均匀,防止夹坏玻璃板。
2、 凝胶配制过程要迅速, 催化剂TEMED要在注胶前再加入,否则凝结无法注胶.注胶过程最好一次性完成,避免产生气泡。
3、 水封的目的是为了使分离胶上延平直,并排除气泡。
4、 凝胶聚合好的标志是胶与水层之间形成清晰的界面。
5、 样梳需一次平稳插入,梳口处不得有气泡,梳底需水平。
6、 要使锯齿孔内的气泡全部排出,否则会影响加样效果。
7、 注射器不可过低,以防刺破胶体,也不可过高,在样下沉时会发生扩散。
8、 为避免边缘效应,最好选用中部的孔注样.
9、 剥胶时要小心,保持胶完好无损,染色要充分。
凝胶不均匀冷却,中间冷却不好, 可能装置不合适, 凝胶和玻璃挡板底有bubble,或者俩遍聚合不完全,样品溶解不好,样品中含有不溶性颗粒, 电极不平衡或者加样位置偏了,加样量过多。蛋白质在十二烷基硫酸钠(SDS)和巯基乙醇的作用下,分子中的二硫键还原,氢键等打开,形成按1.4gSDS/1g蛋白质比例的SDS-蛋白质多肽复合物,该复合物带负电,故可在聚丙烯酰胺凝胶电泳中向正极迁移,且主要由于凝胶的分子筛作用,迁移速率与蛋白质的分子量大小有关,因此可以浓缩和分离蛋白质多肽。
聚丙烯酰凝胶电泳分离蛋白质多数采用一种不连续的缓冲系统,主要分为较低浓度的成层胶和较高浓度的分离胶,配制凝胶的缓冲液,其pH值和离子强度也相应不同,故电泳时,样品中的SDS-多肽复合物沿移动的界面移动,在分离胶表面形成了一个极薄的层面,大大浓缩了样品的体积,即SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳的浓缩效应。
[试剂]
1、30%凝胶贮备液:称取29g 丙烯酰胺(Acr)和1g 甲叉-双丙烯酰胺(Bis),加蒸馏水至100ml,滤纸过滤贮存。
2、10% SDS:称取SDS 10g 加蒸馏水至100ml。
3、10%过硫酸胺(AP)
4、N,N,N’,N’四甲基乙二胺(TEMED)
5、5×电泳缓冲液:于900ml蒸馏水中分别加入15.1g Tris、94g甘氨酸、5g SDS,混匀后加蒸馏水至1 000ml。
6、1.5mol/L Tris-HCl(pH8.8)和1.0mol/L Tris-HCl(pH6.8)
7、电泳加样缓冲液
10mmol/LpH6.8 Tris
200mmol/LDTT
4%SDS
0.2% 溴酚兰
20% 甘油
8.正丁醇
[操作步骤]
1.配制分离胶浓度8%、体积15ml
H2O 6.9ml
30%凝胶贮备液 4.0ml
1.5mol/L Tris-HCl(pH8.8) 3.8ml
10%SDS 0.15ml
10%过硫酸胺 0.15ml
TEMED 0.01ml
2.一旦加入TEMED,混匀后立即小心地将分离胶注入准备好的玻璃板间隙中,为成层胶留有足够空间。用毛细管轻轻在其顶层加入几毫升正丁醇,以阻止空气中的氧气对凝胶聚合的抑制作用。
3.聚合完成之后,倒掉覆盖液体,用去离子水洗凝胶上部数次,尽可能用吸水纸吸干顶端的残存液体。
4.配制5%成层胶5ml,插入梳子,小心避免混入气泡,垂直放置室温下。H2O 3.4ml 30%凝胶贮备液 0.83ml 1.0mol/Ltris-HCl(pH6.8) 0.63ml
10%SDS 0.05ml
10%过硫酸胺 0.05ml
TEMED 0.01ml
5.在成层胶聚合时,将样品与加样缓冲液混匀,100℃加热3min。
6.成层胶聚合完成后,用去离子水冲洗梳孔以除去未聚合的丙烯酰胺,将凝胶放入电泳槽上。
7.加样
8.电泳:开始时电压为8V/cm凝胶,染料进入分离胶后,将电压增加到15V/cm凝胶,继续电泳直到染料抵达分离胶底部,断开电源。
9.取下凝胶,固定、染色或进行Western blot分析。
2楼2013-07-13 18:49:27
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