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知足1989

铁虫 (初入文坛)

[求助] RNA提取图片解析

这个是我提取的RNA，一般情况下会出现三条带，但是我这个出现了好多带，在18S下边多出了一条带，求解这个是什么原因造成的，多出的那条带是什么？谢谢各位。
RNA提取图片解析
2013.06.06-2.jpg
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1楼 2013-07-12 20:10:27
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longrna

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-07-13 08:14:50
知足1989: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-07-14 14:42:55
提的质量挺好的。
其实几条带跟物种以及物种处生长时期有关。你随便百度一下都会出现说RNA有多条带的现象。
另外，有少许gDNA污染呵。
下次上样量减少为1/3或许跑出来更好看。可以不用跑这么久。
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伟大航线....
2楼2013-07-12 22:55:44
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-07-13 08:15:11
是什么来源的RNA，从什么组织里提的？如果是植物叶片，往往会提出大量叶绿体RNA（原核属性），所以会有很多带。
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3楼2013-07-12 23:29:04
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知足1989

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by longrna at 2013-07-12 22:55:44
提的质量挺好的。
其实几条带跟物种以及物种处生长时期有关。你随便百度一下都会出现说RNA有多条带的现象。
另外，有少许gDNA污染呵。
下次上样量减少为1/3或许跑出来更好看。可以不用跑这么久。

嗯，查了一下，说是叶绿体DNA。在反转录的第一步gDNA应该就可以消化完了吧。这个能用来跑qRT-PCR行吗？我请教了一下我的师兄师姐，他们说有降解，但是我自己觉得还好吧，接下来要做荧光，不知道能不能用。
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4楼2013-07-13 16:19:20
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知足1989

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-07-12 23:29:04
是什么来源的RNA，从什么组织里提的？如果是植物叶片，往往会提出大量叶绿体RNA（原核属性），所以会有很多带。

嗯，是叶片里的，应该是叶绿体DNA，就是不知道能不能用来跑荧光，会不会对结果有影响，在网上查了一下，好像荧光定量对RNA的质量要求挺高的。
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5楼2013-07-13 16:21:22
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grape_vine

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by longrna at 2013-07-12 22:55:44
提的质量挺好的。
其实几条带跟物种以及物种处生长时期有关。你随便百度一下都会出现说RNA有多条带的现象。
另外，有少许gDNA污染呵。
下次上样量减少为1/3或许跑出来更好看。可以不用跑这么久。

补充一点，感觉质量已经可以了，但是应该还稍微有点降解的
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6楼2013-07-13 20:16:29
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
知足1989: 金币+3, ★有帮助 2013-07-14 14:42:28
引用回帖:
5楼: Originally posted by 知足1989 at 2013-07-13 16:21:22
嗯，是叶片里的，应该是叶绿体DNA，就是不知道能不能用来跑荧光，会不会对结果有影响，在网上查了一下，好像荧光定量对RNA的质量要求挺高的。...

叶绿体DNA需要用DNase处理，消化后的样品可以反转录做荧光定量PCR。如果是叶绿体RNA，可以不用管，当然这对总RNA定量存在一定影响。
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7楼2013-07-13 23:58:10
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