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MOQIA1989

新虫 (初入文坛)

[求助] 载体酶切位点与目的片段重复

第一次做分子实验,选择了PMD-19T载体,连接目的片段后,再亚克隆到PET-28a上,现在遇到了个问题,就是当时在设计引物加酶切位点时,只考虑到了PET-28a和目的片段,设计出的酶切位点在PMD-19T上都有,怎么吧啊,可以用吗,加的位点是HindⅢ和EcoRⅠ。。。。大家帮帮忙吧。。。
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kehuang611

新虫 (小有名气)

完全可以啊,不用重新设计,本来就不必考虑PMD-19T,应其只是用于克隆测序一般,你用高保真酶扩增你的片段后加A,然后酶连测序,验证你的片段扩增的正确性,然后用你片段中没有酶切位点的酶HindⅢ和EcoRⅠ酶切,这样然后用同酶酶切pEt28a+,酶连就对了,这样过程中完全不必考虑PMD-19T的。
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4楼2013-06-25 12:56:09
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rv1nm2y

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhangxingc: 金币+3, 鼓励新虫应助,欢迎常到微生物版 2013-06-25 11:41:38
和我用的酶切位点是一样的,我用了pEt28a+
PMD-19T载体应该只是一个保留这个目的片段的把?用PCR扩增,设计引物,这时候引物就该注意点了,引物就包括ECORI 和HindIII酶切位点最好再弄点你们的目标基因的片段,要不然估计会把PMD-19T的基因给扩增出来,这样子就只扩增含有酶切位点的目标基因了,然后琼脂糖电泳一下看看有没有扩增出来目标基因。
随后目标基因和pEt28a+同时进行双酶切,DNA连接酶16℃连接过夜,然后再做一个琼脂糖电泳,一个是连接之后的,还有一个是没有连接的目标基因和pet28a都进行酶切之后的混合液,跑完电泳看看有没有顺利连接就好了。
2楼2013-06-25 11:34:00
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MOQIA1989

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by rv1nm2y at 2013-06-25 11:34:00
和我用的酶切位点是一样的,我用了pEt28a+
PMD-19T载体应该只是一个保留这个目的片段的把?用PCR扩增,设计引物,这时候引物就该注意点了,引物就包括ECORI 和HindIII酶切位点最好再弄点你们的目标基因的片段,要不 ...

在目的片段与PMD-19T连接后,实验预计是用上面两个酶将目的片段切下来,然后电泳,切胶回收目的片段,然后连接PET-28a,但是比如载体ECORI到目的片段ECORI距离是A,目的片段长是B,目的片段hindIII到载体hindIII的距离是C,双酶切后得到的片段长度可能是A+B,A+B+C,B+C,A,B,C。这可怎么办,需要重新设计一条只在pet-28a上有的酶切位点的引物吗?
3楼2013-06-25 12:36:06
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kehuang611

新虫 (小有名气)

★ ★ ★
zhangxingc: 金币+3, 鼓励新虫积极应助 2013-06-25 13:29:04
在目的片段与PMD-19T连接后,实验预计是用上面两个酶将目的片段切下来,然后电泳,切胶回收目的片段,然后连接PET-28a,但是比如载体ECORI到目的片段ECORI距离是A,目的片段长是B,目的片段hindIII到载体hindIII的距离是C,双酶切后得到的片段长度可能是A+B,A+B+C,B+C,A,B,C。这可怎么办,需要重新设计一条只在pet-28a上有的酶切位点的引物吗?

还有这种说法就有问题,楼主应该明白酶切的话只要在酶量做够时,只要有酶切位点就会切开,所以酶切后剩下的只会是带两段酶切末端的你的片段。
向大家学习
5楼2013-06-25 12:59:20
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