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huanyi

金虫 (小有名气)

[求助] 帮我看看我的PCR那可能出了状况~

大家好~本人初次接触微生物,老师要求做个菌群分析~
用的引物是古菌的109和518,这个PCR出来为什么这么模糊,背景也很白~我到目前为止不会看图,只是与别人的比觉得不好,没有达到目标效果。。大家能不能分析下?(没有mark,四个都是模板)
帮我看看我的PCR那可能出了状况~
第一次PCR.JPG
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bleach060452

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-06-19 09:59:23
huanyi: 金币+5, 有帮助, 好的,谢谢啊~~菌群分析,就是想看看有什么菌,分析一下有哪些产甲烷菌~第一次就看看有没有P出来,还以为marker可以不放。。 2013-06-19 11:55:50
照相时用凝胶成像仪的软件可以调节的,效果会好很多的,胶的颜色白不是问题╮(╯_╰)╭

关键看你的条带:四个都有清晰单一条带,第3道结果最好;由于你没加marker,无法判断大小和产物的量,下次一定要加~~有一些二聚体,不过优不优化影响不大。

对于“菌群分析”不太了解,不知道你的目的,不过感觉这结果可以,最多也就是需要优化一下。

纯属个人拙见。。。
岂能尽如人意,但求无愧我心
6楼2013-06-19 09:09:14
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bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
1949stone: 金币+1, 严重同意 2013-06-19 07:05:27
我觉得挺好的啊, PCR的产物比较少所以曝光时间长了点造成图片的背景较强. 不过marker下次一定要带.
2楼2013-06-18 23:23:23
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武穆大成

木虫 (著名写手)

笨蛋

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
1949stone: 金币+1, 严重同意 2013-06-19 07:05:45
有引物二聚体,可以优化下减少二聚体,同时点mark ,确认大小
3楼2013-06-18 23:43:24
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huanyi

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bullfrog325 at 2013-06-18 23:23:23
我觉得挺好的啊, PCR的产物比较少所以曝光时间长了点造成图片的背景较强. 不过marker下次一定要带.

这样可以吗?第一次做,老师又不懂,自己的分析,与别人比较觉得条带不亮,而且背景很白。我想着下一步做DGGE,不知道行不行。
专注于最重要的那件事,但也不要拒绝其他的
4楼2013-06-19 08:39:32
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