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yan.007133

铁虫 (小有名气)

[求助] 求3‘RACE引物设计

同源克隆得到一段序列,只有90多bp,想进行3’RACE进行扩增,takara 3‘RACE试剂盒。
序列为TGTCATATCTCTGGTGCTCATGTCAATCCTGCTGTCTCTTTCGGGTTTGCATGTGTCCGAAGGCTTCCTTGGCCGCAGGTACTCATTCCAAGCCTGAACT
之前设计了两个引物扩增出来的都是弥散的条带,求有相关经验的人帮忙设计
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yan.007133

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhoulubin at 2013-06-18 16:29:22
90bp太短,都有可能不是目的基因,建议blast比对一下

我是同源克隆得到的序列,而且是未测序物种,所以无法得知是否是目的片段。blastp是有目的蛋白保守结构域的,但是我也极度怀疑是不是凑巧???99bp的片段做RACE有希望吗?全长1kb左右!帮帮我吧,谢了
3楼2013-06-21 16:43:09
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