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憧雪313

银虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白质SDS-PAGE跑的条带很多,但做二维电泳点很少,且纵条纹很多,请教什么原因呢?

提蛋白质,先做个小胶SDS-PAGE,跑出来的条带挺多,也挺清楚的,但是做二维电泳的结果却很不好:点很少,纵条纹很多。用的考马斯亮蓝染色的,操作方法技术都正确,就是找不到原因。求助,求助,求助!!!非常感谢!!!
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
憧雪313(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,感谢你的慷慨解囊,期待你的精彩。 2013-05-15 08:38:51
憧雪313: 金币+1, 有帮助 2013-05-16 12:02:09
首先,你的上样量够吗?跑一向普通的SDS-PAGE的样品放到二维的2D上的量是不够的,起码需要增加3-5倍。
其次,你说的纵向条纹是什么样的,有图吗?纵向条纹的话,应该是第二向的问题。如果可以排除第二向胶本身的问题的话,有可能是胶条下来变性处理没做好。
2楼2013-05-15 08:05:39
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DBWJ

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
憧雪313: 金币+1, 有帮助 2013-05-16 12:00:52
憧雪313: 金币+1, ★★★很有帮助 2013-05-17 21:59:53
你做的胶条是多少cm的啊?纵条纹是2相的事,最好能传个图,顺便把实验方法附上,这样也好找原因。
3楼2013-05-15 11:53:56
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憧雪313

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-05-15 08:05:39
首先,你的上样量够吗?跑一向普通的SDS-PAGE的样品放到二维的2D上的量是不够的,起码需要增加3-5倍。
其次,你说的纵向条纹是什么样的,有图吗?纵向条纹的话,应该是第二向的问题。如果可以排除第二向胶本身的问 ...

我用11cm胶条跑的,上样量300ug,小胶SDS-PAGE上样量是15ug。上样量够的,第二向胶配方应该没什么问题呢,就是在凝胶上放胶条时,加完琼脂糖后胶条与凝胶之间有空隙,不能紧挨着,别的都没什么问题。    呵呵,胶拍照拍的很不好。

小胶SDS-PAGE.jpg



二维胶.jpg

4楼2013-05-15 14:43:21
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憧雪313

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by DBWJ at 2013-05-15 11:53:56
你做的胶条是多少cm的啊?纵条纹是2相的事,最好能传个图,顺便把实验方法附上,这样也好找原因。

我用酚提取法提取的,材料是水果。
5楼2013-05-15 14:47:25
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
憧雪313: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-05-16 12:01:43
引用回帖:
4楼: Originally posted by 憧雪313 at 2013-05-15 14:43:21
我用11cm胶条跑的,上样量300ug,小胶SDS-PAGE上样量是15ug。上样量够的,第二向胶配方应该没什么问题呢,就是在凝胶上放胶条时,加完琼脂糖后胶条与凝胶之间有空隙,不能紧挨着,别的都没什么问题。    呵呵,胶拍 ...

胶条与第二向胶面最好不要有空隙,否则会影响蛋白进入第二向胶。你的胶条是否用琼脂糖固定。第二向也最好跑个marker,看是不是胶的问题。从你小SDS胶上看,样品有不少残留在点样孔,是不是你的样品含有较多疏水蛋白,变性比较困难?我的意思说,如果样品变性不容易,可能会影响胶条的in gel变性效果。

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6楼2013-05-15 23:57:29
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憧雪313

银虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-05-15 23:57:29
胶条与第二向胶面最好不要有空隙,否则会影响蛋白进入第二向胶。你的胶条是否用琼脂糖固定。第二向也最好跑个marker,看是不是胶的问题。从你小SDS胶上看,样品有不少残留在点样孔,是不是你的样品含有较多疏水蛋白 ...

恩恩,谢谢谢谢! 我的胶条用琼脂糖固定,但是我推胶条至第二向胶面时,都不能使胶条紧挨胶面,它们之间总是有空隙,但是没气泡的。 我之前跑的时候加marker的,但是marker总出不完7条带,都是5到6条。配的胶是12%的。  变性比较困难,那怎么解决呢?    还有我跑完二向后把胶条也染色了,发现胶条上还有一些蛋白质没进入二向胶中,这个是不是跟我放胶条也有很大关系啊? 非常感谢!
7楼2013-05-16 11:56:36
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
憧雪313: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-05-16 16:32:50
憧雪313: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-05-17 22:00:10
引用回帖:
7楼: Originally posted by 憧雪313 at 2013-05-16 11:56:36
恩恩,谢谢谢谢! 我的胶条用琼脂糖固定,但是我推胶条至第二向胶面时,都不能使胶条紧挨胶面,它们之间总是有空隙,但是没气泡的。 我之前跑的时候加marker的,但是marker总出不完7条带,都是5到6条。配的胶是12%的 ...

胶条中残留少量蛋白也是正常的,不过残留太多就不好了。残留蛋白主要是因为变性不充分,蛋白表面没有充分结合SDS,电荷不够,所以电泳时会跑得非常慢。胶条从第一向下来因为表面有油,油会影响变性时溶液浸入胶条。先用镊子夹住胶条在滤纸上尽量吸去油,然后再进行变性处理。如果变性困难的样品,可以适当延长变性时间,实在不行的话,可以增加变性时的平衡缓冲液中SDS的含量。放胶条也有一定技巧,也很难说清楚。一般是先在第二向胶面上放电泳缓冲液,然后把胶条推到胶面尽量接触,然后再吸去多余的缓冲液,再用琼脂糖固定。
8楼2013-05-16 12:11:19
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憧雪313

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-05-16 12:11:19
胶条中残留少量蛋白也是正常的,不过残留太多就不好了。残留蛋白主要是因为变性不充分,蛋白表面没有充分结合SDS,电荷不够,所以电泳时会跑得非常慢。胶条从第一向下来因为表面有油,油会影响变性时溶液浸入胶条。 ...

恩 恩 好的 非常感谢!收获不少。
9楼2013-05-16 16:32:19
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