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crazymouse66

金虫 (正式写手)

[求助] 土壤总DNA的荧光定量PCR引物

请问大家,在做土壤总DNA的荧光定量PCR时,大家用的是16sRNA的哪两对引物啊?我在网上找了一对926f5’ AAA CTC AAA GGA ATT GAC GG 3'和1100r5’ GGG TTG CGC TCG TTG 3',不知道这对行不行呢?还有,在别人的论文看到一对引物的长度193bp,但是他是用来做基因扩增的,而且这段引物的正向很长,有57个碱基,如下图显示的。请问这两对引物哪一对比较适合呢?或者说大家还有更适合的吗?谢谢大家。

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crazymouse66

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by genolab at 2013-04-11 09:00:35
57个碱基的引物是DGGE用的引物,是含有GC夹子的。不能用于QPCR。你可以将GC夹子序列去掉,就可以使用了。

谢谢你
4楼2013-04-11 20:55:54
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WSW_Alone

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
crazymouse66: 金币+30, ★★★★★最佳答案, 真的十分感谢,谢谢你的帮助。 2013-04-11 08:41:19
zhangxingc: MicEPI+1, 很有价值!欢迎常到微生物版 2013-04-11 08:51:57
bacterial
Q16S-1 F 5'-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3'     
Q16S-1 R 5'-ATTACCGCGGCTGCTGG-3'           
Reference: Dynamics of bacterial communities during solid-state fermentation using agro-industrial wastes to produce poly-γ-glutamic acid, revealed by real-time PCR and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE)
我们实验室用的这个
處世樹為模,本固任從枝葉動;立身錢作樣,內方還要外邊圓。
2楼2013-04-10 23:44:14
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genolab

金虫 (著名写手)


57个碱基的引物是DGGE用的引物,是含有GC夹子的。不能用于QPCR。你可以将GC夹子序列去掉,就可以使用了。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2013-04-11 09:00:35
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