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crazymouse66金虫 (正式写手)
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土壤总DNA的荧光定量PCR引物
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请问大家，在做土壤总DNA的荧光定量PCR时，大家用的是16sRNA的哪两对引物啊？我在网上找了一对926f5’ AAA CTC AAA GGA ATT GAC GG 3'和1100r5’ GGG TTG CGC TCG TTG 3'，不知道这对行不行呢？还有，在别人的论文看到一对引物的长度193bp，但是他是用来做基因扩增的，而且这段引物的正向很长，有57个碱基，如下图显示的。请问这两对引物哪一对比较适合呢？或者说大家还有更适合的吗？谢谢大家。 截图00.png |
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 博士 |
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crazymouse66
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WSW_Alone
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【答案】应助回帖
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zhangxingc: MicEPI+1, 很有价值！欢迎常到微生物版 2013-04-11 08:51:57
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bacterial Q16S-1 F 5'-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3' Q16S-1 R 5'-ATTACCGCGGCTGCTGG-3' Reference: Dynamics of bacterial communities during solid-state fermentation using agro-industrial wastes to produce poly-γ-glutamic acid, revealed by real-time PCR and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) 我们实验室用的这个 |
2楼2013-04-10 23:44:14
| 57个碱基的引物是DGGE用的引物，是含有GC夹子的。不能用于QPCR。你可以将GC夹子序列去掉，就可以使用了。 |
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3楼2013-04-11 09:00:35
10