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马马和虎虎

新虫 (小有名气)


[交流] 荧光定量 Real time 引物设计为什么要跨内含子?

荧光定量PCR引物为什么要跨内含子设计,大家都说是为了避免提RNA时残留基因组的干扰,但是即使跨了内含子,假如有基因组残留,Real time PCR中还是能P出比cDNA大的一条带(含内含子的条带),探针同样会结合这条大的片段,不会只结合小的片段,还是会干扰定量,除非引物只能扩增cDNA,不能扩增基因组,那就不存在基因组的干扰了。很困惑,请各位指教。非常感谢。
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匿名

用户注销 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
tuobaohua(金币+1): 积极应助,欢迎常来科研版! 2012-02-29 08:37:13
马马和虎虎: 回帖置顶 2012-02-29 17:33:25
本帖仅楼主可见
4楼2012-02-29 00:35:52
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普通回帖

马马和虎虎(金币+1):谢谢参与
wenjing120(金币+1): 积极应助! 2012-02-28 08:39:55
引物若跨内含子的话,引物仅能以3'端的一小部分结合基因组DNA,这样的话Tm会很低。在较高的退火温度下,引物几乎无法和基因组DNA结合来引发聚合,而主要是与能够完全配对的cDNA结合并引发反应。
http://zhidao.baidu.com/question/155967688.html

http://ask.bbioo.com/search/?q=% ... ;page=1&order=0

http://muchong.com/html/201004/1920944.html
2楼2012-02-28 08:38:47
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quiller2000

木虫 (著名写手)



马马和虎虎(金币+1):谢谢参与
可以不用除DNA
3楼2012-02-28 10:37:59
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lurencyj

木虫 (著名写手)


学习到了,多谢
5楼2012-02-29 00:56:37
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