| 查看: 5140 | 回复: 13 | |||
[求助]
请教如何将下载下来的蛋白中的小分子配体删掉?
|
|
因为要进行对接 从网上下载了几个大分子蛋白进行对接 由于里面都有小分子配体 需要把他抽提删掉。请问该怎么做呢?目前在用sybyl ,autodock这两个软件,不太会用 请教一下。谢谢各位! 另外导师说这几个酶里的小分子配体都与其形成了共价键 有什么办法把他删掉呢 ? 具体怎么操作呢? [ Last edited by 高興丶 on 2013-4-7 at 14:15 ] |
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
Autodock |
» 猜你喜欢
博士读完未来一定会好吗
已经有24人回复
导师想让我从独立一作变成了共一第一
已经有9人回复
到新单位后,换了新的研究方向,没有团队,持续积累2区以上论文,能申请到面上吗
已经有11人回复
读博
已经有4人回复
JMPT 期刊投稿流程
已经有4人回复
心脉受损
已经有5人回复
Springer期刊投稿求助
已经有4人回复
小论文投稿
已经有3人回复
申请2026年博士
已经有6人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
分子对接前,含有配体的复合蛋白怎么处理?HETATM开头的元素要删除吗
已经有9人回复
请教各位有关分子对接的问题
已经有5人回复
急问,怎么得到蛋白复合物中的蛋白和配体的结合界面
已经有8人回复
LAMMPS是否适用于研究小型有机分子的溶剂效应?
已经有4人回复
求助,已有PDB结构的DS同源建模步骤,谢谢
已经有11人回复
请教高人,我的pymol软件导入蛋白后进行cartoon时,出现的怎么是loop结构?
已经有13人回复
蛋白分子建模 小分子化合物画图 酶与配体的分子模拟
已经有11人回复
求助:关于基因表达调控机制的问题
已经有9人回复
sybyl完成分子对接后,如何将配体和蛋白一起导出为pdb文件?
已经有12人回复
适配体aptamer与蛋白结合以及与互补链结合作用力哪个比较大呢?
已经有14人回复
配体与打分分子不能很好对接,怎么回事?
已经有8人回复
怎样设置柔性残基?
已经有6人回复
【求助】分子对接后如何计算配体小分子和受体蛋白质相应残基的平面角、面心距、点面距
已经有8人回复
【求助】请问怎样除去蛋白质复合物上已经结合上的配体和小分子?
已经有7人回复
2楼2013-04-07 16:46:41
lrf1980
新虫 (小有名气)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 41 (小学生)
- 金币: 1254.2
- 红花: 3
- 帖子: 136
- 在线: 52.5小时
- 虫号: 2060967
- 注册: 2012-10-14
- 专业: 药物化学
3楼2013-04-07 16:55:19
4楼2013-04-07 18:01:16
wangyan10
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 36 (小学生)
- 金币: 8272.5
- 散金: 58
- 红花: 4
- 帖子: 368
- 在线: 254.3小时
- 虫号: 1089510
- 注册: 2010-09-04
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学

5楼2013-04-07 18:55:36
6楼2013-04-08 14:18:03
7楼2013-04-08 14:18:13
8楼2013-04-08 14:18:20
xuxm03
金虫 (小有名气)
- 应助: 24 (小学生)
- 金币: 1053.6
- 散金: 5
- 红花: 2
- 帖子: 276
- 在线: 461.2小时
- 虫号: 757207
- 注册: 2009-04-25
- 专业: 生物化学
9楼2013-04-08 22:23:50
xuxm03
金虫 (小有名气)
- 应助: 24 (小学生)
- 金币: 1053.6
- 散金: 5
- 红花: 2
- 帖子: 276
- 在线: 461.2小时
- 虫号: 757207
- 注册: 2009-04-25
- 专业: 生物化学
10楼2013-04-08 22:24:50













回复此楼

