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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 请教如何将下载下来的蛋白中的小分子配体删掉？
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高興丶

铁虫 (初入文坛)

[求助] 请教如何将下载下来的蛋白中的小分子配体删掉？

因为要进行对接 从网上下载了几个大分子蛋白进行对接 由于里面都有小分子配体 需要把他抽提删掉。请问该怎么做呢？目前在用sybyl ，autodock这两个软件，不太会用 请教一下。谢谢各位！
另外导师说这几个酶里的小分子配体都与其形成了共价键 有什么办法把他删掉呢 ？ 具体怎么操作呢？

[ Last edited by 高興丶 on 2013-4-7 at 14:15 ]
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1楼 2013-04-07 13:09:48
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xuxm03

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
都很麻烦，直接终端下运行
grep -E '^ATOM|^END' protein.pdb
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9楼2013-04-08 22:23:50
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xuxm03

金虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by xuxm03 at 2013-04-08 22:23:50
都很麻烦，直接终端下运行
grep -E '^ATOM|^END' protein.pdb

都很麻烦，直接终端下运行
grep -E '^ATOM|^END' protein.pdb > apoprotein.pdb
赞一下 回复此楼
10楼2013-04-08 22:24:50
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