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银虫 (小有名气)

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[求助] 请教有关转录组测序的问题

各位大侠好，我最近用illumina测试了两个转录组，拼接以后得到很多序列，经过注释之后发现有很多基因和NCBI上一个已知基因（同一物种的）能够注释上，于是我将那个已知基因与我拼接的基因一个个做比较，有几个基因有一百左右完全匹配，有几个基因相似度很低，请教一下这种情况我该怎么处理呢，是认为拼接错误呢还是该怎么办呢？设计引物用PCR一个个检测？这样的情况不止这一个基因，还有很多个基因也是这种情况，请大家不吝指教，谢谢！

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1楼2013-03-07 10:53:55

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