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铜虫 (初入文坛)

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[求助] 提取RNA条带28/18为什么总是不成两倍关系啊？

尊敬的各位大侠们，这是我提的植物叶片RNA跑的1%非变性琼脂糖电泳，因为后续实验对RNA要求很高很高，所以提了很多很多次了，但是总是没有传说中的28S/18S亮度为2/1啊！而且很多情况下尽然反过来，看似28S/18S为1/2是怎么回事儿呢？降解了吗？请多多指教啊！愁死。。。

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男儿何不带吴钩，收取关山五十州

1楼2012-11-07 14:38:39

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gaoyang636

木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-11-14 16:27:36

后续要求高，是要做RNA-seq么

其实很多物种的RNA胶图都不是2:1的关系的……不少植物的也是这样的。你想确定它的质量，权威的方法是找一个安捷伦2100，跑一下样品，它会给出详细的报告（针对植物有个专门的设定，这也再次证明植物的RNA和动物不大一样）
如果搞不到，只能看胶图的话，那么你可以看弥散严不严重，看条带亮度，是不是边缘清晰（sharp否？），这些都比2：1啥的要重要