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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » DS同源建模后结构不完整
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kokps

新虫 (初入文坛)

[求助] DS同源建模后结构不完整

使用DS进行目的蛋白的同源建模，使用3个PDB为模板，发现建模结果很多地方都没有确定的结构，不知道该怎么办优化。
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1楼2012-11-01 15:12:07
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hanxuan8912

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by kk8993011 at 2012-11-23 15:32:34
可以使用多模板建模，同时需要经过多次优化

多模版建模，需要哪些优化呢？我直接进行建模的话，很失败……
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因为梦想所以选择远方，因为孤独，所以选择坚强：没有比人更高的山没有比较更长的路，梦想与现实总有接壤的地方！
4楼2012-12-29 10:14:52
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-11-01 15:58:57
看看序列与模板的蛋白序列一致性有多少~要是小于35%，同源模建做出的结果是否可信十分值得怀疑
赞一下 回复此楼
2楼2012-11-01 15:21:35
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kk8993011

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-11-23 17:19:38
可以使用多模板建模，同时需要经过多次优化
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3楼2012-11-23 15:32:34
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