应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » DS同源建模
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 1289  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

考研生涯

金虫 (正式写手)

[求助] DS同源建模

用DS做点突变后，准备跑动力学，想问下还要不要优化模型？如果需要的的话，怎么去做呢？本人是初学者，希望能说清楚下，感激不尽啦~~~模板用的是晶体结构。
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2012-05-30 19:55:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

870609

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-06-01 16:15:36
考研生涯: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-06-01 21:23:48
如果之前的模型已经结构很稳定，经过优化的话只做个别点突变的模型与之前模型差别应该不会很大，不做优化问题也不大，如果想要优化的话，可以先来个sidechain refinement，接着分步做EM，最后做MD跑到平衡。
赞一下 回复此楼
2楼2012-06-01 14:16:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

考研生涯

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 870609 at 2012-06-01 14:16:00
如果之前的模型已经结构很稳定，经过优化的话只做个别点突变的模型与之前模型差别应该不会很大，不做优化问题也不大，如果想要优化的话，可以先来个sidechain refinement，接着分步做EM，最后做MD跑到平衡。

谢谢哦
回复此楼
3楼2012-06-01 21:23:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-06-04 00:11:43
其实真不用，MD过程就是一个优化的过程了。
赞一下 回复此楼
4楼2012-06-03 13:20:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

考研生涯

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by caixin5120 at 2012-06-03 13:20:58
其实真不用，MD过程就是一个优化的过程了。

其实我没有优化就直接跑MD了，也是可以的，就是有点担心这样会不会有影响，毕竟是新手嘛，谢谢啦
赞一下 回复此楼
5楼2012-06-03 21:48:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 考研生涯 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 071000生物学，一志愿深圳大学296分，求调剂 +12 TIckLw 2026-04-06 12/600 2026-04-07 19:45 by macy2011
[考研] 273求调剂 +35 麦小叮当 2026-04-06 41/2050 2026-04-07 17:39 by 孙俊俊
[考研] 材料调剂 +15 一样YWY 2026-04-01 15/750 2026-04-07 15:54 by dxlg
[考研] 085602调剂 初试总分335 +10 19123253302 2026-04-05 10/500 2026-04-07 15:23 by 小乔同学ya
[考研] 292求调剂 +4 lilllllxccc 2026-04-05 5/250 2026-04-07 09:29 by 纺大杨老师
[考研] 求调剂 +5 小沢 2026-04-03 5/250 2026-04-06 22:45 by 875465
[考研] 第一志愿东南大学物理313，有科研竞赛获奖经历，希望物理复试调剂 +3 马内橙 2026-04-05 3/150 2026-04-06 10:32 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿C9的化学工程（085602） 340分，感觉校内调剂无望，求调剂 +12 万事宜臻 2026-04-04 12/600 2026-04-06 07:46 by 无际的草原
[考研] 考研调剂 +5 美丽的youth_ 2026-04-04 6/300 2026-04-06 06:57 by houyaoxu
[考研] 308求调剂 +3 终不似从前 2026-04-05 3/150 2026-04-05 22:23 by hemengdong
[考研] 272分求调剂 +4 wangyile2233 2026-04-02 4/200 2026-04-05 22:21 by 286640313
[考研] 材料调剂 +6 一样YWY 2026-04-05 6/300 2026-04-05 20:30 by 南航~万老师
[考研] 求调剂 +10 Hll胡 2026-04-04 10/500 2026-04-05 20:09 by nepu_uu
[考研] 344材料与化工调剂 +9 调剂上岸玘 2026-04-03 9/450 2026-04-04 23:10 by happyddm
[考研] 085400电子信息319求调剂（接受跨专业调剂） +5 星星不眨眼喽 2026-04-03 6/300 2026-04-04 21:50 by hemengdong
[考研] 11408 一志愿西电，277分求调剂 +4 zhouzhen654 2026-04-03 4/200 2026-04-04 18:10 by 猪会飞
[考研] 334求调剂 +8 曾仰之 2026-04-03 8/400 2026-04-04 11:16 by w_xuqing
[考研] 311求调剂 +11 勇敢的小吴 2026-04-02 11/550 2026-04-03 21:46 by qlm5820
[考研] 085501一志愿天工大，机械专硕求调剂，跨材料 +3 33上 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:08 by 1753564080
[考研] 085801 总分275 本科新能源 求调剂 +19 bradoner 2026-04-01 23/1150 2026-04-03 10:07 by linyelide
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭