应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » DS同源建模
51/1返回列表
查看: 1292  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

考研生涯

金虫 (正式写手)

[求助] DS同源建模

用DS做点突变后，准备跑动力学，想问下还要不要优化模型？如果需要的的话，怎么去做呢？本人是初学者，希望能说清楚下，感激不尽啦~~~模板用的是晶体结构。
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2012-05-30 19:55:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

考研生涯

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 870609 at 2012-06-01 14:16:00
如果之前的模型已经结构很稳定，经过优化的话只做个别点突变的模型与之前模型差别应该不会很大，不做优化问题也不大，如果想要优化的话，可以先来个sidechain refinement，接着分步做EM，最后做MD跑到平衡。

谢谢哦
回复此楼
3楼2012-06-01 21:23:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

870609

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-06-01 16:15:36
考研生涯: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-06-01 21:23:48
如果之前的模型已经结构很稳定，经过优化的话只做个别点突变的模型与之前模型差别应该不会很大，不做优化问题也不大，如果想要优化的话，可以先来个sidechain refinement，接着分步做EM，最后做MD跑到平衡。
赞一下 回复此楼
2楼2012-06-01 14:16:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-06-04 00:11:43
其实真不用，MD过程就是一个优化的过程了。
赞一下 回复此楼
4楼2012-06-03 13:20:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

考研生涯

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by caixin5120 at 2012-06-03 13:20:58
其实真不用，MD过程就是一个优化的过程了。

其实我没有优化就直接跑MD了，也是可以的，就是有点担心这样会不会有影响，毕竟是新手嘛，谢谢啦
赞一下 回复此楼
5楼2012-06-03 21:48:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 本科西工大 0856 324求调剂 +7 wysyjs25 2026-04-09 7/350 2026-04-09 21:07 by 学员jIFgUM
[考研] 085601初试330分找调剂 +8 流心奶黄包l 2026-04-09 8/400 2026-04-09 19:19 by 5268321
[考研] 316求调剂 +3 想读研究生( ?∵ 2026-04-07 3/150 2026-04-09 17:31 by wp06
[考研] 电子信息279求调剂，有书读就行 +3 wwwooden 2026-04-08 5/250 2026-04-09 17:05 by 大三不四
[考研] 一志愿武理车辆 281 求调剂 +5 上岸研究生. 2026-04-07 5/250 2026-04-09 15:56 by only周
[考研] 265求调剂 +4 风说她早忘了 2026-04-07 4/200 2026-04-09 13:59 by only周
[考研] 求调剂 +15 熊二想上岸 2026-04-04 15/750 2026-04-08 22:52 by 猪会飞
[考研] 软件工程求调剂22软工296分求调剂，接受跨调 +4 yangchen2017 2026-04-08 5/250 2026-04-08 21:56 by 土木硕士招生
[考研] 机械工程313分找工科调剂 +3 双一流本科机械 2026-04-08 3/150 2026-04-08 20:41 by 土木硕士招生
[考研] 本科211，293分请求调剂 +12 莲菜就是藕吧 2026-04-03 13/650 2026-04-08 20:30 by 背对大海出发
[考研] 调剂求助（生物与医药） +6 @6952 2026-04-06 6/300 2026-04-07 23:52 by lys0704
[考研] 11408 325分 +3 jgtxuxgkx 2026-04-07 3/150 2026-04-07 23:10 by lbsjt
[考研] 305求调剂 +4 77Qi 2026-04-06 4/200 2026-04-07 20:06 by shanqishi
[考研] 材料与化工371求调剂 +14 陪琳看海 2026-04-04 15/750 2026-04-06 06:59 by houyaoxu
[考研] 308求调剂 +3 终不似从前 2026-04-05 3/150 2026-04-05 20:07 by 啵啵啵0119
[考研] 考研调剂 +3 mcbbc 2026-04-04 3/150 2026-04-05 10:03 by barlinike
[考研] 311分 22408 求调剂 +3 bing_bot 2026-04-03 3/150 2026-04-05 00:43 by chongya
[考研] 306求调剂 +3 hyb上名工 2026-04-02 3/150 2026-04-04 18:12 by 热情沙漠
[考研] 怎么删帖子啊 +3 缝曦1000 2026-04-04 3/150 2026-04-04 14:20 by 土木硕士招生
[考研] 考研调剂 +3 Draa 2026-04-03 3/150 2026-04-03 17:37 by hgwz7468
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭