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kokps

新虫 (初入文坛)

[求助] DS同源建模后结构不完整

使用DS进行目的蛋白的同源建模,使用3个PDB为模板,发现建模结果很多地方都没有确定的结构,不知道该怎么办优化。
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-11-01 15:58:57
看看序列与模板的蛋白序列一致性有多少~要是小于35%,同源模建做出的结果是否可信十分值得怀疑
2楼2012-11-01 15:21:35
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kk8993011

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-11-23 17:19:38
可以使用多模板建模,同时需要经过多次优化
3楼2012-11-23 15:32:34
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hanxuan8912

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by kk8993011 at 2012-11-23 15:32:34
可以使用多模板建模,同时需要经过多次优化

多模版建模,需要哪些优化呢?我直接进行建模的话,很失败……
因为梦想所以选择远方,因为孤独,所以选择坚强:没有比人更高的山没有比较更长的路,梦想与现实总有接壤的地方!
4楼2012-12-29 10:14:52
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