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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【讨论】同源建模后酶的辅因子怎么处理
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aquariusy

木虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】同源建模后酶的辅因子怎么处理 已有3人参与

同源建模得到一个酶的模型是不含辅因子的，那么对于含有辅因子的酶（特别是辅因子与酶共价结合的情况）该怎么处理才能把辅因子加上？对接可以吗？
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1楼 2010-12-15 20:41:32
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wdali

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
敢问楼主用的什么软件建的模？
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统治这个世界的是想象力
2楼2010-12-15 21:34:57
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aquariusy

木虫 (小有名气)
用的是swiss-model建的模，我对了一下它的活性中心，和模板的活性中心几乎一样，就是不知道辅因子怎么放进去
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3楼2010-12-15 21:54:28
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-12-17 12:34:48
引用回帖:
Originally posted by aquariusy at 2010-12-15 21:54:28:
用的是swiss-model建的模，我对了一下它的活性中心，和模板的活性中心几乎一样，就是不知道辅因子怎么放进去

用MODELLER的GUI,详情参见本版的同源模建帖~http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1882309&fpage=1，下载链接在93楼
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4楼2010-12-15 22:25:09
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aquariusy

木虫 (小有名气)
我看到了，是这个功能：3.杂原子建模，但是gui上没看到关于这个
的选项啊，请问要怎么操作？
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5楼2010-12-15 22:55:01
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-17 12:34:56
引用回帖:
Originally posted by aquariusy at 2010-12-15 22:55:01:
我看到了，是这个功能：3.杂原子建模，但是gui上没看到关于这个
的选项啊，请问要怎么操作？

有的，在界面下方有个包含杂原子，打上√就行~include hetro
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6楼2010-12-16 13:31:06
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aquariusy

木虫 (小有名气)
看到了，谢谢~~
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7楼2010-12-16 19:21:39
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