24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1811  |  回复: 15

wangning__

木虫 (正式写手)

[求助] 为什么PCR扩增出来使这个样子,各位高手帮忙支招吧!

古菌槽式扩增,以全长的50,100,150,200稀释为模版,得到下面的图,为什么有杂带,后来提高退火温度2℃,4℃,延伸时间缩短15s,20s,还是这个样子,换了新的体系试剂还是没有消除,这是什么原因呢?
PS:引物为109/1510;109/515,扩增产物用于DGGE

求求各位大侠给支个招吧,小妹实在是找不出原因了。

2000的marker,分别为全长扩增产物稀释50倍,100,150,200倍,其它条件一致
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

乌拉拉
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhsDONG

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
wangning__: 金币+1 2012-08-05 09:23:34
可能是引物的特异性不是很强
2楼2012-08-04 14:33:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

robert-RBT

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wangning__: 金币+3 2012-08-05 09:24:01
减少pcr循环数和模版量试一下。除了引物的可能行外,也有可能是模版质量不好,有降解。
3楼2012-08-04 21:18:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

eagles123

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
wangning__: 金币+1 2012-08-05 09:24:13
也可以试试 用PCR产物稀释100倍后作为模板再扩增看还有没有杂带
4楼2012-08-04 22:00:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snzydong

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
模板量适当降低 再说如果目的条带对 你可以切胶回收 不必要纠结这个问题

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2012-08-05 09:08:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

西区五号楼

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wangning__: 金币+3, 有帮助 2012-08-06 09:45:47
可以切胶回收之后!也可以做个巢式PCR试试!做DGGE的话,这个亮度貌似已经很好了!
6楼2012-08-05 09:24:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangning__

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by snzydong at 2012-08-05 09:08:48
模板量适当降低 再说如果目的条带对 你可以切胶回收 不必要纠结这个问题

这个已经是稀释后的了,还是不可以。PCR产物不好的话会严重影响DGGE的,所以必须优化,但是我又不会切胶回收,跪求指点一下...
乌拉拉
7楼2012-08-05 09:26:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dajiong

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wangning__: 金币+2, 有帮助 2012-08-06 09:46:21
引用回帖:
7楼: Originally posted by wangning__ at 2012-08-05 09:26:59
这个已经是稀释后的了,还是不可以。PCR产物不好的话会严重影响DGGE的,所以必须优化,但是我又不会切胶回收,跪求指点一下......

切胶回收买个试剂盒就可以了呀         promega的tiangen的omega的都有    按说明书就可以了。
哦也
8楼2012-08-05 21:18:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

damaomao

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

9楼2012-08-06 16:31:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sd3824289

木虫 (正式写手)

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流经验 2012-08-07 15:37:57
建议楼主做个温度梯度试试,我筛选条件的时候都是用这个方法,很好的!基本上做一次就知道最适退火温度了,一般情况下,如果两次PCR用到得酶不一样,也会导致在相同的退火温度下得到不一样的结果!模板浓度如果高,建议加0.5μl就够了,如果浓度不高,就得加1μL,引物浓度应该都是10MM!祝楼主好运!

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

坚持,就像流星,即使知道最后的结果,也要勇敢的走到最后!
10楼2012-08-07 09:26:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wangning__ 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 294求调剂 +5 淡然654321 2026-04-15 5/250 2026-04-15 19:36 by coolfishwll
[考研] 307中医考研调剂 +4 于以采蘩 2026-04-14 4/200 2026-04-15 19:14 by AN流800
[考研] 290调剂生物0860 +37 哇哈哈,。 2026-04-11 43/2150 2026-04-15 18:55 by zhuwenxu
[考研] 273求调剂 +5 白居不易. 2026-04-09 7/350 2026-04-15 13:16 by 西北望—风沙
[考研] 271求调剂 +31 2261744733 2026-04-11 31/1550 2026-04-15 10:50 by shenshen207
[考研] 调剂 +12 月@163.com 2026-04-11 12/600 2026-04-14 15:37 by zs92450
[教师之家] 转长聘了 +7 简单化xn 2026-04-13 7/350 2026-04-14 14:50 by xindong
[考研] 食品与营养(0955)271求调剂 +15 升格阿达 2026-04-12 16/800 2026-04-14 13:18 by 浮若_安生
[考研] 085600材料与化工329分求调剂 +24 叶zilin 2026-04-13 25/1250 2026-04-14 09:20 by 试管破裂
[考研] 339求调剂 +4 hanwudada 2026-04-12 4/200 2026-04-13 12:03 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿0807 数一英一 313 有没有二轮调剂 +12 emokidd 2026-04-08 13/650 2026-04-13 08:32 by lhj2009
[教师之家] 山东双非院校考核超级无底线,领导幸灾乐祸,教师遭殃恐 +3 qut2026 2026-04-11 7/350 2026-04-12 20:24 by qut2026
[考研] 求调剂,一志愿材料科学与工程985,365分, +8 材化李可 2026-04-11 10/500 2026-04-12 08:42 by 852137818
[考研] 280求调剂 +7 兮兮夜夜 2026-04-09 10/500 2026-04-12 00:33 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿厦大0856,306求调剂 +15 Bblinging 2026-04-11 15/750 2026-04-11 22:53 by 314126402
[考研] 288求调剂 +15 代fish 2026-04-09 16/800 2026-04-11 10:26 by wwj2530616
[考研] 085506-求调剂-285分 +3 雷欧飞踢 2026-04-08 3/150 2026-04-11 08:37 by zhq0425
[考研] 初试261 +3 Asht少 2026-04-10 6/300 2026-04-10 16:38 by Asht少
[考研] 求机械专硕297第二批调剂 +5 拾柒12。 2026-04-08 5/250 2026-04-09 16:43 by 允当适度
[考研] 083200 初试305分 求调剂 暂不考虑跨专业 +15 Claireyyyy 2026-04-09 15/750 2026-04-09 16:11 by zhuimr
信息提示
请填处理意见