24小时热门版块排行榜    

查看: 2104  |  回复: 15

wangning__

木虫 (正式写手)

[求助] 为什么PCR扩增出来使这个样子,各位高手帮忙支招吧!

古菌槽式扩增,以全长的50,100,150,200稀释为模版,得到下面的图,为什么有杂带,后来提高退火温度2℃,4℃,延伸时间缩短15s,20s,还是这个样子,换了新的体系试剂还是没有消除,这是什么原因呢?
PS:引物为109/1510;109/515,扩增产物用于DGGE

求求各位大侠给支个招吧,小妹实在是找不出原因了。

2000的marker,分别为全长扩增产物稀释50倍,100,150,200倍,其它条件一致
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

乌拉拉
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhsDONG

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
wangning__: 金币+1 2012-08-05 09:23:34
可能是引物的特异性不是很强
2楼2012-08-04 14:33:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

robert-RBT

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wangning__: 金币+3 2012-08-05 09:24:01
减少pcr循环数和模版量试一下。除了引物的可能行外,也有可能是模版质量不好,有降解。
3楼2012-08-04 21:18:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

eagles123

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
wangning__: 金币+1 2012-08-05 09:24:13
也可以试试 用PCR产物稀释100倍后作为模板再扩增看还有没有杂带
4楼2012-08-04 22:00:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snzydong

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
模板量适当降低 再说如果目的条带对 你可以切胶回收 不必要纠结这个问题

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2012-08-05 09:08:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

西区五号楼

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wangning__: 金币+3, 有帮助 2012-08-06 09:45:47
可以切胶回收之后!也可以做个巢式PCR试试!做DGGE的话,这个亮度貌似已经很好了!
6楼2012-08-05 09:24:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangning__

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by snzydong at 2012-08-05 09:08:48
模板量适当降低 再说如果目的条带对 你可以切胶回收 不必要纠结这个问题

这个已经是稀释后的了,还是不可以。PCR产物不好的话会严重影响DGGE的,所以必须优化,但是我又不会切胶回收,跪求指点一下...
乌拉拉
7楼2012-08-05 09:26:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dajiong

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wangning__: 金币+2, 有帮助 2012-08-06 09:46:21
引用回帖:
7楼: Originally posted by wangning__ at 2012-08-05 09:26:59
这个已经是稀释后的了,还是不可以。PCR产物不好的话会严重影响DGGE的,所以必须优化,但是我又不会切胶回收,跪求指点一下......

切胶回收买个试剂盒就可以了呀         promega的tiangen的omega的都有    按说明书就可以了。
哦也
8楼2012-08-05 21:18:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

damaomao

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

9楼2012-08-06 16:31:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sd3824289

木虫 (正式写手)

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流经验 2012-08-07 15:37:57
建议楼主做个温度梯度试试,我筛选条件的时候都是用这个方法,很好的!基本上做一次就知道最适退火温度了,一般情况下,如果两次PCR用到得酶不一样,也会导致在相同的退火温度下得到不一样的结果!模板浓度如果高,建议加0.5μl就够了,如果浓度不高,就得加1μL,引物浓度应该都是10MM!祝楼主好运!

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

坚持,就像流星,即使知道最后的结果,也要勇敢的走到最后!
10楼2012-08-07 09:26:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wangning__ 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:39 by 9i7PCSZyMzot
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:27 by 9i7PCSZyMzot
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:27 by 9i7PCSZyMzot
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:15 by 9i7PCSZyMzot
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:15 by 9i7PCSZyMzot
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:03 by 9i7PCSZyMzot
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 00:51 by 9i7PCSZyMzot
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 3/150 2026-09-20 00:03 by 9i7PCSZyMzot
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-20 00:03 by 9i7PCSZyMzot
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:51 by 9i7PCSZyMzot
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:39 by 9i7PCSZyMzot
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:27 by 9i7PCSZyMzot
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:27 by 9i7PCSZyMzot
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:03 by 9i7PCSZyMzot
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-18 7/350 2026-09-19 21:03 by 9i7PCSZyMzot
[教师之家] 现代”学阀”该如何界定 +3 iaeyuan 2026-09-19 3/150 2026-09-19 20:52 by 没昵称呀
[基金申请] 国社科系统bug了,是不是要放榜了? +7 kynobel 2026-09-16 9/450 2026-09-19 14:52 by 接好运婷
[有机交流] 各位大神,目前国内有哪些比较好用的逆合成软件? 20+3 zapen 2026-09-15 9/450 2026-09-18 18:17 by zapen
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组|2027级博士研究生招生公告 +7 水士口 2026-09-16 8/400 2026-09-16 13:47 by kkklens
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组招收博士研究生 +8 两三岁ss 2026-09-14 8/400 2026-09-16 09:46 by 水士口
信息提示
请填处理意见