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wangning__

木虫 (正式写手)

[求助] 为什么PCR扩增出来使这个样子,各位高手帮忙支招吧!

古菌槽式扩增,以全长的50,100,150,200稀释为模版,得到下面的图,为什么有杂带,后来提高退火温度2℃,4℃,延伸时间缩短15s,20s,还是这个样子,换了新的体系试剂还是没有消除,这是什么原因呢?
PS:引物为109/1510;109/515,扩增产物用于DGGE

求求各位大侠给支个招吧,小妹实在是找不出原因了。

2000的marker,分别为全长扩增产物稀释50倍,100,150,200倍,其它条件一致
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乌拉拉
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wangning__

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by snzydong at 2012-08-05 09:08:48
模板量适当降低 再说如果目的条带对 你可以切胶回收 不必要纠结这个问题

这个已经是稀释后的了,还是不可以。PCR产物不好的话会严重影响DGGE的,所以必须优化,但是我又不会切胶回收,跪求指点一下...
乌拉拉
7楼2012-08-05 09:26:59
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zhsDONG

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
wangning__: 金币+1 2012-08-05 09:23:34
可能是引物的特异性不是很强
2楼2012-08-04 14:33:48
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robert-RBT

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wangning__: 金币+3 2012-08-05 09:24:01
减少pcr循环数和模版量试一下。除了引物的可能行外,也有可能是模版质量不好,有降解。
3楼2012-08-04 21:18:12
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eagles123

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
wangning__: 金币+1 2012-08-05 09:24:13
也可以试试 用PCR产物稀释100倍后作为模板再扩增看还有没有杂带
4楼2012-08-04 22:00:14
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