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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 总dna电泳有条带，但PCR后只有引物二聚体
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tsuei428

银虫 (小有名气)

[交流] 总dna电泳有条带，但PCR后只有引物二聚体

提取总dna后直接电泳有条带（如图），但PCR后电泳却只有引物二聚体。请教各位是何缘故。PCR参数：50ul体系，buffer（5ul），Mg2+（2ul），DMSO（2.5ul），2.5mM dNTP（4ul），20uM ITS1-F（4ul），20uM ITS4-R（4ul），总dna（1ul），taq酶（1ul），水（26.5）

pcr后电泳图



总DNA直接电泳图
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1楼 2012-07-15 14:15:51
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reallpf

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
mengfei8336: 金币+10, 谢谢关注。 2012-07-16 20:15:30
amisking: 金币+5, MolEPI+1, 鼓励发帖帮助解答问题。 2012-07-16 20:16:01
补充一下：
一般PCR没有目标条带的时候，可能有下列原因：
1.模板:含有抑制物，含量低 2.Buffer对样品不合适 3.引物设计不当或者发生降解 4.反应条件：退火温度太高，延伸时间太短
对策:
1.纯化模板或者使用试剂盒提取模板DNA或加大模板的用量 2.更换Buffer或调整浓度 3.重新设计引物（避免链间二聚体和链内二级结构）或者换一管新引物 4.降低退火温度、延长延伸时间
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11楼2012-07-16 14:21:37
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Arrennew

铁杆木虫 (正式写手)
★
tsuei428(金币+2): 谢谢参与
两者之间有什么关系啊？只能说明你没P出来而已，引物确定没问题就提高退火温度。
赞一下 回复此楼
2楼2012-07-15 19:36:50
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j2

木虫 (正式写手)
★
tsuei428(金币+2): 谢谢参与
降低退火温度吧。。。
不加二甲亚砜试过没有，有结果不？或者降低一点二甲亚砜的浓度。二甲亚砜对酶活性有影响的。
赞一下 回复此楼
3楼2012-07-15 20:52:02
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yjqhades

禁虫 (初入文坛)
★
tsuei428(金币+2): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽
5楼2012-07-15 23:29:55
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