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tsuei428

银虫 (小有名气)


[交流] 总dna电泳有条带,但PCR后只有引物二聚体

提取总dna后直接电泳有条带(如图),但PCR后电泳却只有引物二聚体。请教各位是何缘故。PCR参数:50ul体系,buffer(5ul),Mg2+(2ul),DMSO(2.5ul),2.5mM dNTP(4ul),20uM ITS1-F(4ul),20uM ITS4-R(4ul),总dna(1ul),taq酶(1ul),水(26.5)

pcr后电泳图



总DNA直接电泳图
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reallpf

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
mengfei8336: 金币+10, 谢谢关注。 2012-07-16 20:15:30
amisking: 金币+5, MolEPI+1, 鼓励发帖帮助解答问题。 2012-07-16 20:16:01
补充一下:
一般PCR没有目标条带的时候,可能有下列原因:
1.模板:含有抑制物,含量低 2.Buffer对样品不合适 3.引物设计不当或者发生降解 4.反应条件:退火温度太高,延伸时间太短
对策:
1.纯化模板或者使用试剂盒提取模板DNA或加大模板的用量 2.更换Buffer或调整浓度 3.重新设计引物(避免链间二聚体和链内二级结构)或者换一管新引物 4.降低退火温度、延长延伸时间
11楼2012-07-16 14:21:37
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Arrennew

铁杆木虫 (正式写手)


★
tsuei428(金币+2): 谢谢参与
两者之间有什么关系啊?只能说明你没P出来而已,引物确定没问题就提高退火温度。
2楼2012-07-15 19:36:50
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j2

木虫 (正式写手)


★
tsuei428(金币+2): 谢谢参与
降低退火温度吧。。。
不加二甲亚砜试过没有,有结果不?或者降低一点二甲亚砜的浓度。二甲亚砜对酶活性有影响的。
3楼2012-07-15 20:52:02
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yjqhades

禁虫 (初入文坛)

★
tsuei428(金币+2): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽

5楼2012-07-15 23:29:55
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