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光武故里

木虫 (小有名气)

[求助] 请大家帮我分析一下这张植物块根中提取的基因组DNA电泳图片

今天下午提了一种植物块根的基因组DNA,因为其富含多糖,使用的是改良的CTAB法,采取以下流程:首先在装有粉状样品的离心管中加入2×CTAB裂解液(内含3% PVP)600ul 以及100ul β-巯基乙醇,65℃水浴60min,然后用A【氯仿:异戊醇/24:1】以及B【酚:氯仿:异戊醇/25:24:1】交替抽提后离心,先后顺序依次为:A——A——B——A——B——A,接着离心取上清液,加入-20℃预冷的异丙醇,并放置-20℃冰箱,60min后取出离心,得沉淀(但是实际情况是离心后并无可见的沉淀),用70%的乙醇小心洗涤2次,后用无水乙醇洗涤一次,风干沉淀,加入100ul TE溶解。

其中离心参数为:4℃,12000rpm,10min

电泳检测如图所示:左边是MARKER,最大片段长5000bp,右边是提的DNA,明显感觉不对头啊,请各位帮忙分析找找原因,十分谢谢
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baiyongqin

新虫 (初入文坛)

DNA提取效果很好啊,只是RNA较多,可以用RNase消化即可。因为你的凝胶浓度很大,因此,每个片段之间的距离就相较1%的胶要小很多。建议您下次跑基因组DNA的时候用0.8%--1%之间的凝胶为好。而且你的材料是什么物种,它的基因组多大应该是知道的吧。
祝顺利!
6楼2012-06-13 16:25:26
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