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xiazhiwuxie银虫 (小有名气)
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[求助]
大片段连接问题
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实验室得到一个片段为2300bp左右的DNA序列,但是连接了半个月都没有连上,连接体系是:19T 0.5ul 目的条带 5ul solution I 5ul 过夜4度,16度连接3h 也做过16度连接两夜 做过4度 期间确定目的条带回收正确,连接体系也用了最新的,感受态是买的,在这个条带的靠近3‘端约200bp是已知的,根据这个片段设计引物,扩增约为140bp。 得到的结果:1.不长菌 2.长菌,但是扩增无条带 3.长菌,扩增出140bp,但是测序后,结果告知插入片段只有200bp,且这200bp片段就是已知部分,抽了质粒后得知条带大约就是比2000bp的大点。 我快疯了,折腾了半个月,序列还没得到,求高人指导! |
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9楼2012-04-16 10:27:07
dingfang0707
金虫 (正式写手)
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2楼2012-04-14 20:20:10
ghs25372216
禁虫 (正式写手)
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xiazhiwuxie: 金币+5, ★有帮助, 我昨天想用T4连接酶连着,但是实验室没人做过,今天试试 2012-04-15 10:12:57
小丹木木: 金币+3, 恩,可以试下 2012-04-16 13:54:47
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3楼2012-04-15 09:46:42
【答案】应助回帖
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xiazhiwuxie: 金币+2, ★有帮助, PCR回收后条带清晰 2012-04-16 12:12:16
小丹木木: 金币+3, 鼓励正解解答问题 2012-04-16 13:55:10
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xiazhiwuxie: 金币+2, ★有帮助, PCR回收后条带清晰 2012-04-16 12:12:16
小丹木木: 金币+3, 鼓励正解解答问题 2012-04-16 13:55:10
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1.连接体系为10uL,目的DNA片段应为4.5uL,一般试剂盒都可用,连接温度是不关键因素,时间过夜即可。 2.一定要保证PCR要达到一定浓度和纯度才可以,这一点至关重要。 3.另外,楼主说的300bp引物是菌液PCR检测引物吗?最好用一个载体引物,一个片段上的引物,假阳性会降低,而且最好把全长扩出来。 4.若果菌液PCR扩出来了就不用提质粒了酶切了,可以直接测序。 |

4楼2012-04-15 12:16:44













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