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zhangxn2010

木虫 (著名写手)


[交流] 【求助/交流】连接几次,仍然不见菌落出现

最近做载体构建,很不顺。
主要是把酶切后的片段(约2000bp)连到载体上,转化后总是没有菌落出现。
前些天相同的位置连了另一条片段出现了很多克隆,测序也是对的,现在真是很迷茫(感态应该没问题,因为用的同一批;T4Ligase应该也没问题)

[ Last edited by zhangxn2010 on 2010-12-4 at 09:37 ]

PS:本帖中问题已在2011年解决,当时没有放上具体原因,现做说明,以对有相关问题的虫友有启发。
用相当长的时间排除,最后在电泳液上找出了问题,第一个载体构建完之前一直选用TAE做缓冲液,后来一个刚来的海归博士建议用TBE(理由当然是条带清楚之类的),噩梦就开始了,原来是TBE和胶回收试剂盒有冲突,造成回收产物不能进行连接。
希望虫子们多注意小细节,我因为这点失误耽误近两月,领导眼都快绿了(当然还有其他并行工作,否则直接被炒掉了)。

[ Last edited by zhangxn2010 on 2012-12-11 at 15:10 ]
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sobi

新虫 (初入文坛)



rainwander(金币+1):注意细节是关键,尤其是载体与目的片段的比例 2010-12-06 13:52:13
zhangxn2010(金币+1):谢谢,我会注意的 2010-12-07 12:50:37
zhangxn2010(金币+1): 2011-03-14 13:04:28
我觉得分子实验是非常精细的活,最好每步都做到定性定量,这样才能够在实验失败的时候更加方便快捷的找到实验失败的原因。至于酶切连接,说起来挺简单的,但是细节很重要,希望楼主继续加油,找到原因,祝成功
7楼2010-12-06 12:28:47
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普通回帖

zhangxn2010

木虫 (著名写手)


自己顶一下,希望大家来讨论。
2楼2010-12-04 09:38:04
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iaminxanadu

木虫 (正式写手)



silicare(金币+1):谢谢参与 2010-12-04 10:40:55
zhangxn2010(金币+2):是个好办法,我再试试看 2010-12-04 13:30:10
zhangxn2010(金币+1): 2010-12-06 11:33:59
你不是已经在同一位置连过了吗,可以用这个载体切胶回收后和你的新的片段连接,这时加大浓度,调整比例。
当然也可能是引物合成错误,我遇到过。怎么都连接不上,后来重合成相同引物就很顺利的连上了。
3楼2010-12-04 10:35:50
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zhangxn2010

木虫 (著名写手)


这个版块人很多啊,为什么没有很多人来我的帖子,继续求助.......
4楼2010-12-06 11:32:35
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飞侠8683

新虫 (小有名气)


zhangxn2010(金币+1):我觉得如果酶切不好的话,比如没切开,载体会自连,然后也会出相应菌落啊 2010-12-06 12:22:49
有可能是你目的片段酶切效果不好
5楼2010-12-06 11:36:49
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雪晨

金虫 (小有名气)



silicare(金币+1):谢谢参与 2010-12-06 12:15:58
zhangxn2010(金币+2):Solution1可以用于粘末端连接吗? 2010-12-06 12:21:39
zhangxn2010(金币+1): 2010-12-06 12:21:53
你可以调整载体和片段的比例重新连接,或者你试着用T载体的Solution I 做连接,效果还不错的!
6楼2010-12-06 11:56:11
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tsingo

金虫 (正式写手)


zhangxn2010(金币+1): 2010-12-07 12:50:53
适当增加连接时间,大片段连接到载体上的效率低一些
8楼2010-12-06 12:46:22
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xuqingchun33

银虫 (小有名气)


★ ★
zhangxn2010(金币+1):原来没看过这个操作,试试看 2010-12-07 12:53:25
zhangxn2010(金币+2): 2010-12-07 12:56:22
lstt09nk(金币+2): 感谢分享~ 2011-03-14 09:16:58
1 将目的片段与载体按比例混匀
2  65-70度热击2-3Min,破坏目的片段与载体的二级结构
3 加入连接酶
4 16度连接过夜


另外,做好阴性和阳性对照
9楼2010-12-06 16:31:27
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大白菜123789

铜虫 (小有名气)


zhangxn2010(金币+1): 2010-12-07 12:54:36
同病相怜,以前是一个不长,现在是长了都不是!
在多次总结后明白,问题出在了质粒上,重新提的新质粒,做酶切,完事后,立刻做连接!把感受态也换了吧,试试……
10楼2010-12-06 16:56:41
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雪晨

金虫 (小有名气)


zhangxn2010(金币+1):thank you 2010-12-08 12:19:39
呵呵,Solution I 可以用于粘末端的连接,我以前做过的!
11楼2010-12-07 20:43:17
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YaYa785

银虫 (小有名气)



zhangxn2010(金币+2): 2010-12-08 11:39:13
silicare(金币+1):谢谢参与 2010-12-08 12:22:18
这个原因其实很多,你说还连了另一个片段,是要再连一段形成2个片段的串联?两个末端的酶切位点一致么?和第二段另一个酶切位点buffer的兼容性呢?还有  这第二个片段酶切完全了没有?酶切问题很难确定不是说你把东西加进去就可以切开的,个人觉得是没有切开...切开了多少回连上一些的....再就是连接的问题...多做几个l连接比例试试...转化时感受态细胞浓度也不要太浓了...
12楼2010-12-08 11:27:43
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zhangxn2010

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by YaYa785 at 2010-12-08 11:27:43:
这个原因其实很多,你说还连了另一个片段,是要再连一段形成2个片段的串联?两个末端的酶切位点一致么?和第二段另一个酶切位点buffer的兼容性呢?还有  这第二个片段酶切完全了没有?酶切问题很难确定不是说你把 ...

是这样的,我构建的载体可以放两个不同来源但是相同功能的基因,这两段基因我设计的酶切位点都一样,只是想看看不同来源基因表达量有什么不同,先把一段基因已经连上了,另外一段怎么也连不上,所以来求助。
13楼2010-12-08 12:18:53
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YaYa785

银虫 (小有名气)


zhangxn2010(金币+1): 2011-03-14 13:03:46
引用回帖:
Originally posted by zhangxn2010 at 2010-12-08 12:18:53:

是这样的,我构建的载体可以放两个不同来源但是相同功能的基因,这两段基因我设计的酶切位点都一样,只是想看看不同来源基因表达量有什么不同,先把一段基因已经连上了,另外一段怎么也连不上,所以来求助。

嗯明白了...一步一步排除原因吧...
14楼2010-12-08 12:24:02
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zhangxn2010(金币+2): 最近发现问题了,其实是电泳缓冲液效果不好,建议更换新鲜的TAE 2011-03-14 08:36:54
最近也在做四个载体的构建,两个互补载体,两个GFP定位载体,第一次抱侥幸的心理,回收的载体和目的片段浓度不大,6ul跑胶模糊刚能看到,连了几次均以失败告终,折腾了将近两周无果。后来加大了片段和载体的量,回首时检测条带十分亮,10ul体系连接,16度过夜,都长了斑,初步的载体引物PCR鉴定正确,测序中。。。
15楼2011-03-13 21:39:32
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傲娇的小马尾

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
15楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-03-13 21:39:32
最近也在做四个载体的构建,两个互补载体,两个GFP定位载体,第一次抱侥幸的心理,回收的载体和目的片段浓度不大,6ul跑胶模糊刚能看到,连了几次均以失败告终,折腾了将近两周无果。后来加大了片段和载体的量,回首 ...

同回收的片段与载体不亮,想问问您的连接体系?
16楼2017-07-26 18:25:10
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