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zhangxn2010

木虫 (著名写手)


[交流] 【求助/交流】连接几次,仍然不见菌落出现

最近做载体构建,很不顺。
主要是把酶切后的片段(约2000bp)连到载体上,转化后总是没有菌落出现。
前些天相同的位置连了另一条片段出现了很多克隆,测序也是对的,现在真是很迷茫(感态应该没问题,因为用的同一批;T4Ligase应该也没问题)

[ Last edited by zhangxn2010 on 2010-12-4 at 09:37 ]

PS:本帖中问题已在2011年解决,当时没有放上具体原因,现做说明,以对有相关问题的虫友有启发。
用相当长的时间排除,最后在电泳液上找出了问题,第一个载体构建完之前一直选用TAE做缓冲液,后来一个刚来的海归博士建议用TBE(理由当然是条带清楚之类的),噩梦就开始了,原来是TBE和胶回收试剂盒有冲突,造成回收产物不能进行连接。
希望虫子们多注意小细节,我因为这点失误耽误近两月,领导眼都快绿了(当然还有其他并行工作,否则直接被炒掉了)。

[ Last edited by zhangxn2010 on 2012-12-11 at 15:10 ]
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zhangxn2010

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by YaYa785 at 2010-12-08 11:27:43:
这个原因其实很多,你说还连了另一个片段,是要再连一段形成2个片段的串联?两个末端的酶切位点一致么?和第二段另一个酶切位点buffer的兼容性呢?还有  这第二个片段酶切完全了没有?酶切问题很难确定不是说你把 ...

是这样的,我构建的载体可以放两个不同来源但是相同功能的基因,这两段基因我设计的酶切位点都一样,只是想看看不同来源基因表达量有什么不同,先把一段基因已经连上了,另外一段怎么也连不上,所以来求助。
13楼2010-12-08 12:18:53
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zhangxn2010

木虫 (著名写手)


自己顶一下,希望大家来讨论。
2楼2010-12-04 09:38:04
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iaminxanadu

木虫 (正式写手)



silicare(金币+1):谢谢参与 2010-12-04 10:40:55
zhangxn2010(金币+2):是个好办法,我再试试看 2010-12-04 13:30:10
zhangxn2010(金币+1): 2010-12-06 11:33:59
你不是已经在同一位置连过了吗,可以用这个载体切胶回收后和你的新的片段连接,这时加大浓度,调整比例。
当然也可能是引物合成错误,我遇到过。怎么都连接不上,后来重合成相同引物就很顺利的连上了。
3楼2010-12-04 10:35:50
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zhangxn2010

木虫 (著名写手)


这个版块人很多啊,为什么没有很多人来我的帖子,继续求助.......
4楼2010-12-06 11:32:35
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