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zhang8826857

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 求解释这pcr是啥问题,帮同学问的^_^

这是以质粒为模板,扩增质粒上的EGFP基因,结果没扩出来,是不是模板的量加的太大呀?跑出来的条带是模板吧?我提质粒之后,50ul的pcr体系加了模板0.5微升,没做出来,然后我把提的质粒稀释了10倍,加0.5ul又没做出来,连条带都没有,大家帮着分析下士啥问题呀?(最右边是天根Marker3,200bp,500,800,1200,2000,3000,4500bp,目的片段应该是700左右,从右边数第二三个不是,是帮别人跑了两个样,其余的是pcr的结果


[ Last edited by zhang8826857 on 2012-4-5 at 09:37 ]
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好孩子!
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张文妮

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by xinshen0915 at 2012-04-05 10:01:55:
下面的条带应该是引物二聚体,上面的条带很有可能是质粒模板,在做PCR之前要先检测质粒的浓度,一般以质粒为模板做PCR扩增是应该先稀释模板的。问题可以考虑从几个方面解决:
1、确保你的反应体系没有问题,看是 ...

我第二次做是把模板稀释了10倍的,但是电泳跑出来一点儿条带都没有,不像上面的图还有模板条带和引物二聚体条带。。。这又会是什么问题呢?我确实是梯度扩增,而且退火温度是按引物的Tm设置的。
5楼2012-04-05 10:22:21
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telomerase

至尊木虫 (著名写手)

cain


西瓜: 金币+1, 确实疑问多多 2012-04-05 18:50:39
你跑个质粒看看位置不就知道,是不是了
你质粒4000多?
引物验证过没问题?酶啥的也没事?
我的路靠我的脚踩出来!!!不走寻常路!!!
2楼2012-04-05 09:44:35
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张文妮

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by telomerase at 2012-04-05 09:44:35:
你跑个质粒看看位置不就知道,是不是了
你质粒4000多?
引物验证过没问题?酶啥的也没事?

你好~我就是他的同学,质粒确实是4000多,引物也没有问题,酶是刚买的,Takala的,应给不会有问题。我怀疑是不是模板加的量过了。。
3楼2012-04-05 09:52:49
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xinshen0915

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 应助指数+1, 很认同,考虑梯度很有道理的啊 2012-04-05 11:39:18
zhang8826857: 金币+5, 有帮助 2012-04-05 15:51:34
下面的条带应该是引物二聚体,上面的条带很有可能是质粒模板,在做PCR之前要先检测质粒的浓度,一般以质粒为模板做PCR扩增是应该先稀释模板的。问题可以考虑从几个方面解决:
1、确保你的反应体系没有问题,看是否有某种成分未加,确保DNA聚合酶,dNTP, ddH2O等都没有问题;
2、换一种DNA聚合酶试一下;
3、看是否是退火温度设置不合理,可以考虑梯度扩增;
4、如果换了聚合酶和退火温度还是扩不出来,就得考虑是不是引物设计不合理了。
Go home or stand up!It's your fucking choice.Do you still remember the reason why you are here?
4楼2012-04-05 10:01:55
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