24小时热门版块排行榜    

查看: 4198  |  回复: 19
本帖产生 1 个 MolEPI ,点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

w26150665w

铜虫 (正式写手)

[求助] EcoRI 酶切细菌基因组切不开

为什么我用20ul体系酶切基因组切不开,酶切体系:ddH2O ;基因组1.5-2ul(OD比为1.85,纯度应该没问题);10*H缓冲液 2ul;酶 0.4ul。酶切时间梯度6、7、8、9、10小时,结果仍然切不开基因组,请高手帮帮忙,不胜感激!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

【分子生物】EPI帖

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

多多交流学习
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w26150665w

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by XOooZzz at 2012-03-23 10:27:18:
我的意思是基因组的ecorI位点被保护起来 了,譬如说甲基化什么的。

如果你确保酶没问题,那么换别的酶试试譬如说hindiii,sau3ai
如果都切不开,该考虑你提到基因组是否有问题。譬如说有蛋白残留,与dna结合 ...

嗯,谢谢。因为 我的质粒用EcoRI 是可以切开的 说明酶没有问题,我也用ndeI 切了,也是没切开。基因组OD260/od280=1.85,纯了吧,残留乙醇。。。有可能。。。我快投降了。。。
多多交流学习
9楼2012-03-23 14:22:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 20 个回答

酶切专家

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 好吧,我记得你,你还在推荐你的软件呢 2012-03-23 14:41:52
w26150665w: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-03-23 22:17:45
有两个问题:
你的基因组DNA定量时,浓度时多少?也就是你酶切时的DNA总量是多少?
你的buffer是H,应该用的是Takara的酶吧,你用其他有EcoRI位点的质粒测试过你的酶吗?没准,你的酶因为存储不当,已经失活了。
如果上述两个问题,你都清楚了,我建议你用Double digestion designer设计你的酶切反应体系。
http://www.bioinfomatics.cn/enzyme/login.php,可以申请免费使用。
我前不久,刚利用此系统成功设计了一个很困难的部分酶切,还不错,你可以试一试,希望对你有帮助。
2楼2012-03-22 20:34:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

XOooZzz

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
什么细菌呢?是不定你的菌株对EcoRI酶切位点进行修饰了。譬如说生产EcoRI酶的工程菌的基因组就不能被该酶切开吧?
3楼2012-03-22 21:38:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w26150665w

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 酶切专家 at 2012-03-22 20:34:09:
有两个问题:
你的基因组DNA定量时,浓度时多少?也就是你酶切时的DNA总量是多少?
你的buffer是H,应该用的是Takara的酶吧,你用其他有EcoRI位点的质粒测试过你的酶吗?没准,你的酶因为存储不当,已经失活了。 ...

谢谢,我的DNA纯度在抽提后测了吸光值的,就是1.05ug/ul,我在酶切反应中加了4ul、2ul、1.5ul都切不开的,每次反应的时间呈梯度6-10小时。今天做1ul的。因为师兄用过酶,EcoRI 说是没问题,我用NdeI 切过10小时,也是没切开。
试验进度卡住了。。。很急。。。
多多交流学习
4楼2012-03-23 09:48:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 让我中一个面上吧! +12 大萍1987 2026-08-20 15/750 2026-08-23 20:44 by 大萍1987
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[基金申请] 什么时候开奖? +9 CrisMessi 2026-08-18 10/500 2026-08-23 12:03 by 丶昵称占用
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
请填处理意见