| 查看: 10911 | 回复: 25 | |||||||
| 本帖产生 2 个 MolEPI ，点击这里进行查看 | |||||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||||||
[交流]
发现了beta actin作为内参的一个漏洞
|
|||||||
|
众所周知，β-actin作为基因定量或定性的内参，在PCR实验中有着广泛应用。但是小虫在对人β-actin（gene ID:60，以下简称ACTB）进行引物设计的时候，利用primer-blast对引物分析的时候发现引物除了能扩增出ACTB外，还能扩增出一个编码POTE锚蛋白域家族（gene ID：445582）的基因，于是小虫对俩基因进行了blast，结果发现ACTB cDNA全序列与POTE锚蛋白家族基因CDNA部分序列有着惊人的相似！下面是详细结果： 1.首先，ACTB和POTE锚蛋白基因ID不同，证明这完全是两个不同的基因  这是ACTB的ID  这是POTE的ID 2.其次，俩基因blast结果显示ACTB的全CDNA序列与POTE部分CDNA序列有着惊人的相似度  俩基因的blast结果 3.再次，正因为俩基因的相似，所以在对人ACTB进行引物设计的时候总是能扩增出POTE的部分片段，虽然扩增产物大小相同结构也极相似，但是由于他们是两个不同的基因，所以在已ACTB作为内参的时候实际上增加了初始模板量，这就不是对定量产生错误吗？  对我设计的人ACTB引物进行primer-blast结果，因为迫于保密，所以未上传我的引物序列 最后，基于我碰到的问题，有虫友能解释一下吗？同时因为这个问题如果得不到解释会对很多人的科研情况产生影响，所以建议版主将此帖强调一下，谢谢 [ Last edited by 孙启亮 on 2012-3-3 at 21:37 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 【分子生物】EPI帖 | 收藏 | 杂项 | 基因课表 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
» 猜你喜欢
含氟糖皮质激素的外用抗炎利器醋酸氟轻松
已经有0人回复
-
阿莫奈韦（Amenamevir）：解旋酶-引物酶靶向分子的结构特征与合成路径全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有118人回复
-
利瑞鲁单抗：靶向KIR的NK细胞检查点工具抗体，结构基础与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 发现了一个问题
已经有5人回复
- 6-epi-beta-Cubebene中的epi是什么意思
已经有3人回复
- real-time PCR内参的问题
已经有8人回复
- western blot 内参β-actin图片异常
已经有11人回复
- F-actin与β-actin
已经有9人回复
- 基因/蛋白进化过程中的相关问题！！
已经有7人回复
- Actin（内参基因）为什么叫Actin
已经有6人回复
- western 内参beta-actin条带跑不出来
已经有17人回复
- 求助F-actin和β-actin的区别
已经有12人回复
- 进化树及序列上传相关问题
已经有9人回复
- 关节炎药未来市场：生物制剂唱主角
已经有4人回复
- 和一个美国生物方向faculty聊天.
已经有23人回复
- 做生物材料 RAFT试剂中二硫酯有毒性吗
已经有5人回复
- 电子科技大学生命科学与技术学院植物分子遗传课题组招收研究生调剂信息
已经有36人回复
- Fluent能不能实现按区域计算？把左边算出的速度场作为右边的入口条件？
已经有4人回复
- arcgis中地统计模块应用的问题，DEM怎么作为第二数据集输入呢？请高人指点
已经有3人回复
- ISSR分子标记,50个品种编号重整？
已经有6人回复
- 半定量内参条带的亮度不一样，各位大侠怎么办？？？急呀！！！！！
已经有22人回复
- puc19能作为表达载体用吗/
已经有8人回复
- -NCO含量的测定
已经有14人回复
- 【求助】各位从事生物医用高分子材料的大侠们快来看看呐！！
已经有10人回复
- 【求助/交流】RT-PCR ，内参在哪个步骤添加以及marker何时使用及确定？谢谢
已经有14人回复
- 【求助/交流】primer-blast
已经有3人回复
- 【求助】-NCO的检测问题？
已经有13人回复
- 【分享】2010年复旦大学植物分子生物学暑期学校招生通知
已经有14人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
散金祈福
+5/1150
-
华西生物制药研究院招聘科研助理
+2/400
-
基金申请小调查！预祝申请必定中中中！！祈福！！！
+5/330
-
南方医科大学|生物材料与医学工程团队诚聘科研助理
+2/270
-
焦虑
+1/66
-
面上基金祈福
+1/42
-
瑞典-博后-固态电池-粘结剂-锂离子电池方向
+1/28
-
南京理工大学优青团队催化化学方向招收推免研究生
+1/26
-
流放岭南浮肿了求救
+1/21
-
pcold 原核表达载体
+1/9
-
2027环境工程博士申请
+1/8
-
南方医科大学深圳医院陈烨/余涛教授课题组联合培养博士后招聘
+1/6
-
中科院大连化学物理研究所 招聘 催化剂研发方向 科研助理 2名
+1/5
-
南京大学 智能驱动与感知材料实验室 诚招申请考核博士生/科研助理/博士后
+1/4
-
2026年国自然
+1/3
-
找女友
+1/2
-
清华大学环境课题组招聘环境工作专业客座生研究生2-3名（应用导向）
+1/2
-
新审查指南施行半年，AI方向的专利申请是不是更看"技术味"了？
+1/2
-
澳大利亚南昆士兰大学量子点课题组招收全奖博士生
+1/1
-
清华大学环境课题组招聘环境工作专业客座生研究生2-3名（应用导向）
+1/1
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送鲜花一朵
西瓜: 金币+3, 鼓励交流 2012-03-31 16:57:57
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送鲜花一朵西瓜: 金币+3, 鼓励交流 2012-03-31 16:57:57
|
嗯........ 刚从qPCR的贴子转过来  这些实验都是针对Homo Sapiens的吗？我是做植物的，不是太了解 查了查资料，POTE蛋白的作用现在还是未知是吗，看到说其是在癌症细胞中才会存在，正常体内丰度很低？（不了解这个领域，不知这样说是否合适） 这个网站似乎只是从结构上推断了两者联系http://www.biograph.be/concept/graph/C1384510/C1837146 还有这么一篇文献： A primate-specific POTE-actin fusion protein plays a role in apoptosis 不知是否有何暗示呢.......对这个问题很感兴趣，但非相关专业很吃力，希望能看到楼主在这个问题上的进展  |
18楼2012-03-30 22:31:41
3楼2012-03-03 21:41:53
4楼2012-03-04 01:58:11
5楼2012-03-04 05:39:31
简单回复
2012-03-04 14:52
回复
孙启亮(金币+1):谢谢参与
孙启亮12楼
2012-03-06 09:32
回复
