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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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doudouxiong

铜虫 (小有名气)

[求助] 真菌基因组DAN提取图片,求高人指点

这是我提取的真菌基因组的DNA,因为材料量比较少的问题,因此采用液氮研磨,然后再用CTAB研磨,后用氯仿异戊醇抽提两次,然后用酒精洗,结果每次检测的图片都是这样,请问这是DNA降解还是蛋白质污染,如果是DNA降解,那么是我研磨的时候降解的吗?可能有那种情况就是研磨的时候把DNA研磨断了或者是破了导致的降解这一说法吗?
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doudouxiong

铜虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by honjie at 2011-10-17 10:12:50:
加蛋白酶K60度处理1小时看看,看你的图片有两个泳道有堵孔现象,可能是蛋白,另外,DNA有讲解的现象,建议用SDS破膜剂试试看,减少研磨次数和时间,量若不多,加SDS破膜后反复吹打即可,未必要研磨。

不好意思,本来想给你金币的,结果计算错了,送一段花给你吧
9楼2011-10-18 23:56:39
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liukgg

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
amisking(金币+3): 鼓励应助发帖! 2011-10-16 21:27:32
doudouxiong(金币+3): 我做的是锈菌的夏孢子,孢子壁相当厚,很难磨破的,哎,悲剧的 2011-10-18 23:55:25
蛋白污染的可能性大一些,因为点样孔那都有污染的情况发生。一般来说液氮研磨时应该不会将DNA破坏。试一下别的方法。《6种链霉菌基因组DNA提取方法比较》这篇文献里面讲了几种方法,可以试一下,我以前也是做的链霉菌的,没做过真菌的,但它们的相似度还是挺高的。
山水凤凰
2楼2011-10-16 18:27:00
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547star

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


wanhscn(金币+1): 鼓励交流 2011-10-17 18:49:30
doudouxiong(金币+2): 2011-10-18 23:55:33
抽提前穿插加SDS和蛋白酶K处理看看。
为什么
3楼2011-10-17 01:50:17
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怎么都行

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

遇上这种情况还不如多花点钱用试剂盒呢
4楼2011-10-17 02:11:30
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