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friya0910

新虫 (正式写手)

[交流] 表达载体的构建 已有6人参与

本人已将目的片段载体亚克隆至克隆载体pMD19-T(Simple)载体中,现在要构建表达载体,用限制性内切酶将目的片段从克隆载体上切下,20微升的酶切体系中加10微升的质粒。遇到一个问题就是双酶切后克隆载体片段挺亮的,但目的片段非常的淡(目的片段较小,285bp),这样会不会影响后面的连接反应啊?我看网上说要保证连接的成功,目的片段和载体的浓度最好都大一些。如果做PCR然后酶切PCR产物的话,又存在扩增过程中可能出现突变或者是无法判断是否酶切完全。请各位高手指点一下啊!

图片信息说明,Mark:200、500、800、1200、2000、3000、4500
第一张图,除Mark外左数第一第二泳道分别为NcoI单酶切pET32a和BamHI单酶切pET32a,第三泳道为上述两酶双酶切pET32a,第四泳道为双酶切带有目的片段的pMD19-T(Simple)载体;均是20微升体系,质粒10微升,酶各自1微升,切3h。

第二张图,第一第二泳道NcoI和BamHI分别单酶切pET32a,第三泳道Mark,第四泳道双酶切带有目的片段的pMD19-T(Simple)载体(质粒为公司测序后返还的质粒),切4h,第五泳道为双酶切带有目的片段的pMD19-T(Simple)载体后切胶回收的目的片段,切了3管,每管20微升的体系,10微升的质粒。

第三张图,除Mark外左数第一和第二泳道为双酶切双酶切带有目的片段的pMD19-T(Simple)载体,第三泳道为未酶切的带有目的片段的pMD19-T(Simple)载体。切了4h。

大家帮我看看,pET32a载体3h和4h双酶切切开了没?目的片段的量做连接是不是太少了?有没有什么好的建议啊!






[ Last edited by friya0910 on 2011-8-11 at 09:22 ]
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空谷幽风

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
amisking(金币+2): 鼓励应助 2011-08-10 20:13:39
内容已删除
a?,c??ae~?a,EURc§?c?μé-,cs,,a‘?é?“i1/4?i1/4?i1/4?i1/4?
2楼2011-08-10 19:45:32
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xbl3688

银虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
我用的连接体系中,目的片段与载体的体积比是7:1,这样就好一些。你的载体是高表达载体吗?
生活的乐趣在于善于发现美,学会欣赏美
3楼2011-08-10 20:27:55
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
1949stone(MolEPI+1): 天使大哥 要epi好办啊 2011-08-10 20:51:51
1:楼主的目的片段285bp,确实太小了,20ul体系添加10ul重组载体,然后进行酶切,当然是可以酶切开的,但是你的目的片段由于太小了,所以导致出来的质量太小而很淡,这样做链接的话成功的概率确实很低;何不扩大你的酶切体系至50ul或者更多,然后多添加一些酶,多切一会,然后跑个电泳,做一个切胶纯化,然后再跑电泳定量一下,做一个连接,这样成功概率会大很多;
2:当然了,我还是建议你直接用原来基因的引物做一个PCR,然后纯化,酶切,再纯化,然后进行连接,这样也是很快的,而且成功率也比较高的!

祝好运!
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
4楼2011-08-10 20:50:11
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friya0910

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 空谷幽风 at 2011-08-10 19:45:32:
目的片段的亮度是载体的1/N(N代表载体与目的片段的分子量之比),再加上你的片段比较小,所以你下次酶切的时候请多切些质粒。或者你把重组质粒的跑胶图片给我,我给你推荐个酶切体系。最好是切下来去连表达载体,原 ...

今天跑了个图,现在电脑关了,明天传上来啊!
5楼2011-08-10 21:13:54
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friya0910

新虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xbl3688 at 2011-08-10 20:27:55:
我用的连接体系中,目的片段与载体的体积比是7:1,这样就好一些。你的载体是高表达载体吗?

我用的表达载体是pET32a
6楼2011-08-10 21:14:28
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friya0910

新虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 天使托 at 2011-08-10 20:50:11:
1:楼主的目的片段285bp,确实太小了,20ul体系添加10ul重组载体,然后进行酶切,当然是可以酶切开的,但是你的目的片段由于太小了,所以导致出来的质量太小而很淡,这样做链接的话成功的概率确实很低;何不扩大你 ...

因为我用的TaKaRa的内切酶的推荐体系是20微升,我打电话到公司咨询,他们的技术人员说最好用20微升体系切,我打算切3管,然后一起回收,这样不就相当于做了60微升的体系吗?但是切胶回收的带还不是很亮!
7楼2011-08-10 21:17:55
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ytf149

新虫 (小有名气)

多切一些吧~
加油~
8楼2011-08-10 23:49:36
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imfly77

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
西瓜(金币+4): Good!很有经验! 2011-08-11 11:54:59
引用回帖:
7楼: Originally posted by friya0910 at 2011-08-10 21:17:55:
因为我用的TaKaRa的内切酶的推荐体系是20微升,我打电话到公司咨询,他们的技术人员说最好用20微升体系切,我打算切3管,然后一起回收,这样不就相当于做了60微升的体系吗?但是切胶回收的带还不是很亮!

双酶切很容易做的。。。直接切一个100微升体系没有问题,但是浪费质粒啊。
(说实话,公司那种技术人员很多都是胡说八道。)
如果片段小于500bp,一般来说还是用PCR比较好,基本上不会有突变,50 ul体系能得到大概8-10 ug左右的目的基因。
9楼2011-08-11 09:17:28
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friya0910

新虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by imfly77 at 2011-08-11 09:17:28:
双酶切很容易做的。。。直接切一个100微升体系没有问题,但是浪费质粒啊。
(说实话,公司那种技术人员很多都是胡说八道。)
如果片段小于500bp,一般来说还是用PCR比较好,基本上不会有突变,50 ul体系能得到 ...

那PCR需要用高保真酶吗?我没有高保真酶,一般的可以吗?如果做PCR的话是不是用质粒做模板就可以啊?那50微升体系一般加多少模板量啊?
10楼2011-08-11 09:29:39
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