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cclday

银虫 (正式写手)

[求助] 丝状真菌提取总DNA问题

CTAB法提取真菌DNA最后用异丙醇沉淀后使用无菌水无法完全溶解沉淀,这事怎么回事?

[ Last edited by cclday on 2011-6-14 at 08:39 ]
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

【答案】应助回帖

★ ★ ★
amisking(金币+3, EPI+1): 鼓励应助 2011-06-14 19:00:12
2.4.14.1真菌总DNA的提取
(1)接种菌株至液体培养基中,28℃,180rpm振荡培养3天;
(2)用灭菌纱布过滤,并压干菌体;
(3)将菌丝体倒入研钵(灭菌并预冷),迅速倒入液氮,研磨至粉末状;
(4)将粉末移至1.5mL的EP管中,加入600µL真菌提取液;
(5)加等体积苯酚/氯仿,轻轻倒转混合,10000rpm离心10min;
(6)取400µL上清液移入新的1.5mlLEP管,重复步骤(5);
(7)取上清液,加入两倍体积无水乙醇,-20℃放置30min;
(8)10000rpm 离心10min,75%乙醇洗沉淀2次,真空干燥;
(9)以20µL 1×TE 溶解沉淀;
(10)电泳检测总DNA的浓度。

(5)DNA抽提液的配置
表 2.5  DNA抽提液的配置
成分        浓度
NaCl        200mmol/L
EDTA-Na2        4mmol/L
SDS        2%
Tris-HCl(pH=8.0)        100mmol/L
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
5楼2011-06-14 17:09:56
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普通回帖

疯狂修行者

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

cclday(金币+5): 2011-06-14 09:01:37
amisking(EPI+1): 鼓励应助 2011-06-14 19:00:02
(1)可能是你干燥时间太长了,你可以放在65度下煮一下,或者把水先65度预热。
(2)也可能是你提取的DNA不纯,有杂质。

你可以试一下有尿素提取的方法,以前我用过,参考文献:
一种提取植物基因组DNA的方法 改良尿素法
曹文波 ,郑璐璐 ,谢文海
(1.华中师范大学生命科学学院,武汉430079;2.广西玉林师范学院,广西玉林537000)
戒骄戒躁,坦荡做人,平常心做事,享受生活之美!!
2楼2011-06-14 08:53:24
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cclday

银虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 疯狂修行者 at 2011-06-14 08:53:24:
(1)可能是你干燥时间太长了,你可以放在65度下煮一下,或者把水先65度预热。
(2)也可能是你提取的DNA不纯,有杂质。

你可以试一下有尿素提取的方法,以前我用过,参考文献:
一种提取植物基因组DNA的方法 ...

按照你方法1我先试试。谢谢了
3楼2011-06-14 09:01:25
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fungixx

至尊木虫 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

cclday(金币+5): 2011-06-14 17:08:29
应该是蛋白质没有除尽的  多抽提几次~
几年前踏上火车那一刻都还没有意识到,从此故乡只有冬夏,再无春秋
4楼2011-06-14 15:11:53
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

µL  是发上来之后出现的乱码,微升
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
6楼2011-06-14 17:11:22
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张晓梅ZXM

金虫 (正式写手)

meimeizhang

可能是杂质未除尽~~~~我以前也碰到过,看你提DNA做什么用,如果要求质量不是很高的话可以把溶解了的纯化一下,肯定多少都提出来一些了的。
每天进步一点点,持之以恒!
7楼2011-06-14 18:50:34
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cclday

银虫 (正式写手)

谢谢大家的热心帮助。
8楼2011-06-15 08:20:29
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liuyu_sdili

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2011-06-14 17:09:56:
2.4.14.1真菌总DNA的提取
(1)接种菌株至液体培养基中,28℃,180rpm振荡培养3天;
(2)用灭菌纱布过滤,并压干菌体;
(3)将菌丝体倒入研钵(灭菌并预冷),迅速倒入液氮,研磨至粉末状;
(4)将粉末移至 ...

我也要做真菌方面的课题,不知道氯化苄法行不行,请指教~~~~
9楼2011-06-15 16:40:43
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

引用回帖:
Originally posted by liuyu_sdili at 2011-06-15 16:40:43:
我也要做真菌方面的课题,不知道氯化苄法行不行,请指教~~~~

我对这个方法不了解,第一次听说,所以就查了一下,不敢说我查到的东西是真的或者是最好的,就说一下我的想法:这个方法太浪费时间了,单单是破碎细胞就要保温一个小时!而且操作也不比我用的方法简单,试剂也不省,实在不适合我用,但不是说不适合别人用。这些也只是我的想法,别人怎么看我就不知道了。

http://www.ceps.com.tw/ec/ecjnlarticleView.aspx?atliid=435190
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10楼2011-06-15 17:03:09
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