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xwsooo

银虫 (小有名气)

[交流] PCR产物纯化与回收 已有8人参与

我查过我要做的内切酶活性受PCR反应体系影响比较大,现在打算做个纯化看看,不知道是把PCR产物直接用试剂盒纯化还是先电泳再切胶纯化,哪个回收效率高?(我的PCR产物电泳条带较亮,没杂带,二聚体较淡)
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墨香若水

木虫 (著名写手)

小小囧虫


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
直接回收效率高。割胶回收收率肯定低些。
仕不可不弘毅,任重而道远
3楼2011-06-08 10:23:11
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普通回帖

sfb1020

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
先电泳再切胶回收纯化。
2楼2011-06-08 09:57:37
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shine372

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
1949stone(金币+2): 同意 2011-06-08 16:12:47
割胶回收的会比较纯,而直接回收的还是会有杂
内切酶活性受PCR反应体系影响大的话,建议还是割胶回收吧
4楼2011-06-08 10:29:49
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
1949stone(金币+2): 言之有理 2011-06-08 16:12:57
西瓜(金币+3, EPI+1): 有道理。我们也是,没有砸带就用直接用试剂盒或者乙醇沉淀纯化,有杂带就胶回收。 2011-06-08 18:45:49
你的电泳条带比较亮无杂带的话就可以直接纯化,不过纯化的时候体积要小一些,浓缩一下。。。
如果有杂带的话最好切胶纯化。。。
其实主要还是为了下游实验服务的。。。
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
5楼2011-06-08 10:42:16
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yabxxh

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
1949stone(金币+2): 我也支持楼上 2011-06-08 16:13:10
楼上说的很正确,关键看你有没有杂带,如果没有杂带,且片段大小超过500bp,可以用清洁试剂盒,如果有杂带的话,就必须胶回收。就回收效率而言,二者几乎没有任何分别,清洁试剂盒的优势就是少了跑胶的步骤。
6楼2011-06-08 15:22:47
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如来神掌

捐助贵宾 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
肯定是电泳后切胶回收的效果好了
生活就像直播,没有彩排的机会,不可能从新来过!所以必须把握好现在的每一个瞬间!
7楼2011-06-08 16:20:21
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475502411

铜虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
西瓜(金币+3): 有道理 2011-06-08 18:46:29
切胶回收比较纯,但是UV对其有影响,建议如果特异性比较好,并且条带>500bp就直接用pcr产物纯化就行
可以朝九晚五,也能浪迹天涯
8楼2011-06-08 16:46:39
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xwsooo

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 天使托 at 2011-06-08 10:42:16:
你的电泳条带比较亮无杂带的话就可以直接纯化,不过纯化的时候体积要小一些,浓缩一下。。。
如果有杂带的话最好切胶纯化。。。
其实主要还是为了下游实验服务的。。。

我的PCR产物大小220多bp,无杂带,二聚体弱,这样的合适直接纯化么?(弱弱的说一句,我觉得每次切胶双手都要暴露在UV下,心里还是不舒服啊
9楼2011-06-08 17:11:01
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cdl007

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
西瓜(金币+3): good 2011-06-08 19:05:26
引用回帖:
Originally posted by xwsooo at 2011-06-08 09:49:05:
我查过我要做的内切酶活性受PCR反应体系影响比较大,现在打算做个纯化看看,不知道是把PCR产物直接用试剂盒纯化还是先电泳再切胶纯化,哪个回收效率高?(我的PCR产物电泳条带较亮,没杂带,二聚体较淡)

大家回答问题的时候看清提问者困惑的地方。

他说查过,内切酶活性受PCR反应体系影响大,需要纯化,不是说条带杂需要纯化。


完全直接试剂盒纯化。

试剂盒直接纯化是去除PCR反应体系里的盐离子,taq酶,dNTP,引物等,主要是去除掉盐离子Mg或K,
10楼2011-06-08 17:15:42
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