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【求助/交流】请帮忙,扩增长片段基因遇到困难了
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moonblue789
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[交流]
【求助/交流】请帮忙,扩增长片段基因遇到困难了
最近扩增一个基因碰到了困难,请大家帮帮忙,出出主意,集思广益。谢谢!
基因信息:长度3400bp,GC含量56%,退火温度(Oligo软件推荐):59.8度。
做过温度梯度(56度到62度),用过GC buffer,也改变镁离子浓度(2.5mM),用过某公司的Super Taq,也用过罗氏的扩增长片段的酶,都无能无力。
请各位帮忙了,谢谢!
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2011-01-12 19:10:19
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luzeyan
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★
moonblue789(金币
+1
):谢谢参与
moonblue789(金币+2):引物没换过,模板换过的。谢谢! 2011-01-12 19:49:25
引用回帖:
Originally posted by
moonblue789
at 2011-01-12 19:10:19:
最近扩增一个基因碰到了困难,请大家帮帮忙,出出主意,集思广益。谢谢!
基因信息:长度3400bp,GC含量56%,退火温度(Oligo软件推荐):59.8度。
做过温度梯度(56度到62度),用过GC buffer,也改变镁离子 ...
1.引物有没有问题?
2.换一个模板做做
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2楼
2011-01-12 19:38:21
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bigboy123
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★
moonblue789(金币
+1
):谢谢参与
moonblue789(金币+1):是扩增不出来! 2011-01-13 08:44:57
是量少呀还是不扩增呀?
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2011-01-12 20:07:56
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zgb1982
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moonblue789(金币
+1
):谢谢参与
是什么材料啊也没说。
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4楼
2011-01-12 20:23:46
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ma2007
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用KOD试试
★
moonblue789(金币
+1
):谢谢参与
moonblue789(金币+2): 2011-01-13 08:41:59
用东洋纺的KOD酶试试,这个酶比较强悍,我们实验室常用。
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2011-01-12 21:46:44
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yinsongna
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moonblue789(金币
+1
):谢谢参与
rainwander(金币+1):鼓励积极参与交流~~~ 2011-01-13 00:11:28
moonblue789(金币+2):谢谢!模板没问题,PCR体系没问题,现在就只能考虑引物了 2011-01-13 08:43:08
你是扩增不出来还是怎么回事?
3400真不算长的片段,
首先你得确定你的模板没有问题,扩个内参基因当做对照,如果是模板有问题,你怎么改变体系都是扩不出来的
其次,确定你的PCR体系是正确的,别少加东西了
再次,确定你的引物是否合适
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6楼
2011-01-12 22:16:19
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JASON13
银虫
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我的经验
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moonblue789(金币
+1
):谢谢参与
rainwander(金币+1):鼓励积极参与交流~~~ 2011-01-13 00:11:10
moonblue789(金币+2):谢谢提供方法 2011-01-13 08:43:41
我刚刚成功扩增了2900bp的T7 pol 酶基因,可以先用LAtaq扩增,这种酶保真性不佳,但效率俱佳。获得片段后,测序后获得序列后,可以根据其在中间设计2-3个引物,再用overlap方法扩增。
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7楼
2011-01-12 22:18:12
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bigboy123
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小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+2):good 2011-01-14 10:08:44
一般的Taq酶基本上都能满足这个要求,一般需要对你的PCR引物修改一下,提高特异性和扩增效率,通过换Taq酶起到作用一般不是特别显著。加入PCR增量剂有助于提高PCR产物的量,前提也是在使用普通Taq酶的情况下,现在许多Taq酶中加入的乱七八糟的东西太多。
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8楼
2011-01-14 09:16:57
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