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【求助/交流】引物设计问题
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[交流]
【求助/交流】引物设计问题
我在NCBI下载的序列,然后比对,软件设计,现在想用另一条链设计,那是不是要把这些序列全部转换成反补序列后重新比对进行设计?
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1楼
2010-11-30 10:59:38
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fjt198719
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不用担心,我用55度退火扩增200-3000bp片段任何都没问题,SOE-PCR融合5个片段也没问题,引物有的50bp,有的30bp,一起扩都没问题,感觉就跟菌的GC含量有关,个人愚见
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11楼
2010-11-30 17:07:33
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fjt198719
木虫
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★
lstt09nk(金币+1):感谢交流 2010-11-30 11:44:41
love_st(金币+1):就是因为这条链一直得不到理想的结果 2010-11-30 14:08:57
NCBI下载的基因序列一般都是ATG开始的正义链序列,何必用另外一条链呢。
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2楼
2010-11-30 11:27:22
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jhu132llh
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love_st(金币+1):怎么会一样呢? 2010-11-30 14:13:32
2楼正解
就用正义链设计就行了
何必要用反义链那
其实就算你用另一条链,引物其实也是一样的
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4楼
2010-11-30 12:31:59
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zhaohq1209
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love_st(金币+1):那如果想用所谓的反义链设计,是不是就把序列反补过来进行设计是吗? 2010-11-30 14:10:21
引用回帖:
Originally posted by
fjt198719
at 2010-11-30 11:27:22:
NCBI下载的基因序列一般都是ATG开始的正义链序列,何必用另外一条链呢。
支持!直接P吧
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5楼
2010-11-30 13:35:54
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