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恒星年

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】酶切位点重合了的两个酶的酶切问题已有2人参与

各位高手,我现在要做一个基因的克隆,上游引物只能用NcoI,下游只能用BamHI,但是在载体上这两个酶的酶切位点是重合的,切了一个另外一个就不能切了,应该怎么办啊?
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空谷幽风

金虫 (正式写手)

恒星年(金币+2):谢谢,我去学习下这个方法怎么用,呵呵 2010-11-09 10:29:36
引用回帖:
Originally posted by susizheng at 2010-11-08 12:16:51:
单酶切连接了。

他设计的双酶切连接,你觉得单酶切连接的方案能行吗?
楼主有没有做过重组,就是设两条带重组臂的上下游引物,重新扩片段,载体经单酶切后把片段用重组酶重组到目标载体那
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6楼2010-11-08 13:15:22
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空谷幽风

金虫 (正式写手)

★ ★
reasonspare(金币+2):眼睛要保护 2010-11-10 10:37:34
引用回帖:
Originally posted by amilie030312 at 2010-11-08 16:00:52:
是否可以先切NcoI,用酶补平之后再加几个碱基在前面,再切BamHI,不知道这样是否可行,非要切这样可以试试,能不能做出来就不知道了

此方法不可行,NcoI单酶切完了之后进行补平,把刚产生的NcoI的粘性末端也补平了,之后用BamHI确实有可能切开,但得不到NotI的粘性末端

[ Last edited by 空谷幽风 on 2010-11-8 at 17:13 ]
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10楼2010-11-08 17:05:42
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空谷幽风

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
scelab(金币+5):热心虫友,欢迎多来交流~~~:tiger06::tiger28::tiger23: 2010-11-08 23:05:37
恒星年(金币+2):谢谢,呵呵,受教了 2010-11-09 10:27:12
引用回帖:
Originally posted by susizheng at 2010-11-08 15:44:38:

单酶切连接还是比较成熟和传统得方法的,载体用碱性磷酸酶处理下,以减少自连。
你所说的用同源重组的方法,不知道是不是SLIC,其实很多这种方法文献来源影响因子倒是挺高的,但是可行性和成功率没有他们吹嘘的 ...

如果你的片段是通过PCR方法拿到的,并且在载体的酶切位点多引入碱基对你结果没什么影响的话可以试一下这种方法:把载体用NcoI或BamHI单切,然后补平,在进行一步去磷酸化,减少载体自连。载体这样处理后就可以把片段直接装进去了。

另外,同源重组的方法成功率很高的,我们公司每天都在做重组,如果载体片段处理的都没什么问题,只要长得斑基本都是阳性克隆。

[ Last edited by 空谷幽风 on 2010-11-8 at 17:14 ]
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11楼2010-11-08 17:11:25
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空谷幽风

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):热心鼓励。 2010-11-10 10:20:51
引用回帖:
Originally posted by susizheng at 2010-11-08 21:16:43:
请问你的同源臂是多长,用的重组酶是体外用,还是宿主体内表达的重组酶。一般原核有这么强的重组能力吗?我表示怀疑哦。

重组臂23-25bp,重组酶可以从金斯特买成品(不过比较贵哦),重组完的质粒在Top10中扩增,完全没有问题
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13楼2010-11-10 10:11:18
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